В годы опричнины Иван Федоров с его помощником Петром Мстиславцем был обвинен, как рассказывал он сам, "от многих начальников и духовных властей" в ереси и изгнан из России. Печатный двор был разорен.

Восстановлен Печатный двор был лишь после Смуты, уже при царе новой династии Михаиле Федоровиче Романове, в 1640-е годы. "И повеле царь, повествуется в рукописном сказании ХVII века о создании книг печатного дела, - собрати тех хитрых людей, иже разбегошася от тех супостат, искусни быша к тому печатному делу... И повеле царь дом печатный в ново состроити в царствующем сем граде Москве на древнем сем месте".

На фундаменте прежней типографии было построено двухэтажное здание Правильная палата, в которой находилась сама типография и работали правщики, то есть корректоры. По улице выстроены также двухэтажные каменные палаты с каменными же воротами-башней посредине. Башню строили подмастерье Иван Неверов и англичанин, известный часовщик и строитель Христофор Галовей, который установил первые часы на Спасской башне Московского Кремля. Ворота с центральным проездом и двумя боковыми проходами венчались шпилем таким же, какие в это время устанавливались на кремлевских башнях. Фасадную часть украшали резные каменные колонны, над центральным проездом были помещены изображения единорогов и двуглавого орла. Кроме того, над каждым из боковых проходов укреплены солнечные часы, "служившие поверкою для боевых городских часов".

Впоследствии в боковых проходах устроили лавки "для учинения книжной продажи".

Сначала на Печатном дворе печатали лишь духовные книги, при Петре I начали печатать и светскую литературу. В январе 1703 года здесь была напечатана первая русская газета - "Ведомости", среди выпущенных Печатным двором светских книг было и знаменитое руководство - "Приклады, како пишутся комплименты".

При Екатерине II к палатам вдоль Никольской улицы была сделана пристройка, в 1811 году Александр I подписал распоряжение о сносе обветшавшего здания, построенного при Михаиле Федоровиче, и постройке нового, что и было осуществлено в 1814 году.

В петровские времена Печатный двор стал называться Духовной типографией Святейшего Синода, впоследствии название, упростившись, преобразовалось в Синодальную типографию.

Здание Синодальной типографии, построенное в 1814 году архитектором И.Л. Мироновским, практически осталось до настоящего времени неизменным. Об этом свидетельствует описание "новейшего построения" типографии в "Обозрении Москвы" А.Ф. Малиновского, относящееся к середине 1810-х годов, то есть сделанное сразу после завершения строительства: "Теперь мы видим на том месте воздвигнутое здание готической архитектуры новейшего вкуса с порталом о четырех полуколоннах, испещренных лепною работою с капителями коринфического ордена и с пирамидами под карнизом. Во фронтоне изображен орел, а над готическою аркою, составляющую ворота, помещен по-прежнему лев с единорогом, держащие вензелевое имя царствующего созидателя. По сторонам арки, между окон верхнего и нижнего этажей, находятся двое солнечных часов, а над ними две надписи. На одной повторено прежнее изваяние о построении типографского дома царем Михаилом Федоровичем, а другая означает новую постройку оного в 1814 г." Совершенно очевидно, что Мироновский поставил перед собой задачу сохранить образ старинной постройки и вообще историческую память о Печатном дворе, и это ему удалось.

Новое здание Синодальной типографии у современников вызывало восхищение. "Вот главный фасад сего здания, - писал один из них, - поистине красивейшего не только на Никольской улице, но и по всей Москве... Посмотрите на одни ворота, и вы принуждены будете сознаться, что едва ли где есть подобное!"

Автор путеводителя конца XX века более скромен в своей оценке этого же здания: "Оно привлекает внимание своеобразной архитектурой в стиле русской готики, получившей некоторое развитие в конце ХVIII - начале XIX века".

Однако как художники XIX века, рисовавшие Никольскую улицу, так и в наше время фотографы, снимающие ее, чаще всего выбирают своим объектом Синодальную типографию. Она действительно выделяется среди окружающей застройки своей необычностью, декоративностью и яркостью покраски.

В послереволюционное время во внешнем облике здания произошли небольшие изменения: фасад Синодальной типографии лишился орла на фронтоне (вместо него - герб СССР) и "вензелевого имени" Александра I (вензель просто сбит).

Когда в конце XIX века проводили конкурс на памятник Ивану Федорову, один из конкурсантов предложил установить фигуру первопечатника не на улице или площади, а на кронштейне, прикрепленном к фасаду Синодальной типографии.

В 1920-е годы богатейшая библиотека и архив Синодальной типографии были переданы в государственные музеи и архивы; ее помещения заняты различными учреждениями, в том числе Центральным архивным управлением, при котором в 1930 году был открыт Институт архивоведения. Этот институт, называющийся сейчас Историко-архивным, занимает их до сих пор.

Время от времени у руководства института возникает идея организовать в одном из старинных помещений музей Ивана Федорова, но, к сожалению, осуществить эту идею никак не удается.

Здание Правильной палаты в 1870-е годы было отреставрировано, надстроено и декорировано в "русском стиле". Тогда же оно получило название "Теремок". "Теремок" сохранился и находится во внутреннем дворе Историко-архивного института.

Нельзя, идя по одной стороне улицы, не смотреть на другую, а поскольку наш рассказ касался левой стороны Никольской, теперь поговорим о правой.

Квартал от Ветошного переулка до Богоявленского начинается старинным, в основе своей допожарным (то есть построенным до пожара 1812 года), много раз переделанным и перестроенным зданием, сдававшимся в аренду под лавки. Затем идет щеголеватый, облицованный глазурованными плитками дом 6, построенный в 1910 году (архитектор Н.И.Благовещенский). Это здание предназначалось для конторских помещений.