Окончились наполеоновские войны. В экономической и общественной жизни России наступает некоторое оживление. В развитии русской агрономической мысли начинается второй период. Его начало можно! приурочить к учреждению Московского общества сельского хозяйства (1820), которое стало активным центром сельскохозяйственной мысли в стране. Для этого периода характерно формирование самой науки о сельском хозяйстве в отношении ее задач, методов и содержания применительно к особенностям русского сельского хозяйства, но при весьма значительном еще влиянии западноевропейской агрономии.
Это был период разложения и упадка крепостного хозяйства, ставшего преградой для развития в стране капиталистических отношений и промышленного прогресса. С крепостничеством было несовместимо и рациональное ведение сельского хозяйства. Приспособление крепостного хозяйства к новым экономическим условиям могло идти лишь на основе присущего ему способа производства. В южных степных районах страны, на западе, в известной степени в черноземных губерниях и на юго-востоке, в ту пору преобладало барщинное хозяйство, в нечерноземных, промышленных губерниях — оброчное. Все сельское хозяйство характеризовалось низкой производительностью земледельческого труда. Посевные площади увеличились с 38 млн. дес. в 1802 г. до 58 млн. дес. в 60-е годы (преимущественно в черноземных районах), около 96% всей пахотной площади занимали зерновые хлеба и лишь около 4% приходилось на долю трав и технических культур. За первую половину XIX в. урожайность стояла примерно на одном уровне — сам 3,5 — сам 3,6, что соответствовало 30— 35 пуд./дес. Неурожаи 1820—1821, 1832—1834, 1839, 1843—1845, 1850—1851 гг. охватывали часто десятки губерний и приводили к массовым крестьянским волнениям. Однако в нечерноземной полосе, хотя и медленно., развивались полевое травосеяние и молочное хозяйство, на юго-западе росло свеклосахарное производство (в 1825 г. имелось 7 свеклосахарных заводов, в 1844 г. их было уже 206). На самом юге происходила капиталистическая колонизация, усиление «фермерского» хозяйства с применением наемного труда и машинной техники. Оплотом барщины и крепостного хозяйства являлся земледельческий центр, где происходил возврат к зерновому хозяйству с расширением запашки, сокращением кормовой площади и скотоводства, с уменьшением количества удобрений. Но главные центры зернового производства переносились в южные районы (Новороссия, Поволжье, Заволжье).
Основной проблемой помещичьего хозяйства после Отечественной войны 1812 г. стало увеличение производительности в пределах крепостного хозяйства, повышение его доходности. Оживился интерес к сельскому хозяйству, к поискам более интенсивных его форм. Однако развитие русского сельскохозяйственного предпринимательства на крепостной основе было, естественно, обречено на неудачу. Уже в 40-х годах началась реакция против увлечений «западничеством» и возврат к «самобытным» формам крепостного хозяйства. Борьбу мнений вокруг этих вопросов ярко отражает сельскохозяйственная литература того времени.
К первой половине XIX в. относятся попытки опытного исследования вопросов сельского хозяйства. Усилилось внимание к земледелию и со стороны правительственных органов: после сильного неурожая 1833 г. был создан Комитет об усовершенствовании земледелия, а в 1838 г. учреждено Министерство государственных имуществ. Зарождается сельскохозяйственное образование.
В области сельскохозяйственного образования большую роль сыграли Московская земледельческая школа (1822—1918), Альткустгофская школа профессора Дерптского университета Шмальца (1834—1839), Горыгорецкая школа, основанная в Могилевской губернии в 1836 г. и преобразованная (1848) в первое высшее сельскохозяйственное учебное заведение — Горыгорецкий земледельческий институт, а также кафедры сельского хозяйства («сельского домоводства») в университетах, сначала Московском (М. Г. Павлов), Петербургском (С. М. Усов), а затем и в других.
К 20-м годам относится и возникновение первых опытных полей. В 1821 г. был создан существовавший до 20-х годов нынешнего столетия Бутырский хутор Московского общества сельского хозяйства. Здесь под руководством М. Г. Павлова велось сравнительное изучение севооборотов, испытывались сельскохозяйственные машины и орудия, а также различные полевые культуры. С 1829 по 1838 г. работал Омский опытный хутор, на котором испытывалось около 20 видов растений и изучалась агротехника картофеля, табака и других культур. В 1831 г. был открыт опытный хутор под Верхнеудинском, а в 1833 г. — на Камчатке.
Обобщению местного опыта способствовали возникшие в большом числе в 30—40-х годах сельскохозяйственные общества (Общество сельского хозяйства южной России, Российское общество любителей садоводства, Казанское, Лебедянское, Эстляндское, Ярославское сельскохозяйственные общества и др.). Изучение особенностей местного сельского хозяйства было одной из задач их работы.
С 1821 г. Московское общество сельского хозяйства начало выпускать «Земледельческий журнал». Наравне с другими периодическими изданиями (Труды Вольного экономического общества, «Земледельческая газета» с 1834 г., сельскохозяйственные отделы в общих журналах) он способствовал формированию русской агрономии.
Наиболее яркой фигурой среди представителей русской агрономии этого времени был М. Г. Павлов (1793—1840). Один из первых шеллингианцев, ученик Тэера, учитель Герцена, Лермонтова и других выдающихся людей 40-х годов, физик, медик и агроном, он читал курс сельского хозяйства в Московском университете. Его выступления в печати были посвящены общим вопросам агрономии, ее содержанию и методам, системам хозяйства и т. п. Его перу принадлежал «Курс сельского хозяйства» (1837) и первый у нас курс «Земледельческой химии» (1825). Очень много писал о земледелии и Д. П. Шевелев, впоследствии разорившийся в результате опытов введения плодопеременного хозяйства. В 1834 г. издал «Курс земледелия с приложением к полеводству» первый редактор «Земледельческой газеты» С. М. Усов. Немаловажную роль в развитии научной сельскохозяйственной мысли сыграл С. А. Маслов. Он, в частности, ознакомил русских читателей с известной книгой Тэера «Основания к рациональному земледелию, изданной в 1833 г. с примечаниями Н. Н. Муравьева. В последних, в частности, уже сказалось охлаждение к западноевропейским системам хозяйства й к некритическому переносу их на русскую почву. Увлечение плодосеменным хозяйством в 30—40-е годы пошло на убыль, взоры русских агрономов все более обращались к вопросам, вытекавшим из практики и интересов отечественного зернового хозяйства, а также из задач развития более выгодных технических культур.
В области свеклосеяния и свеклосахарной промышленности много потрудились А. И. Мальцев, А. И. Герард, А. А. Бобринский, Н. П. Шишков и др. Много внимания уделялось и расширению культуры картофеля, в частности, в Сибири. Было положено начало картофеле-паточному производству. На Дону, в Поволжье, в Сибири стала развиваться культура американского табака. Ряд улучшений вводился на Севере в культуру льна (Е. С. Карнович), на Кавказе — в шелководство (А. Ф. Ребров). В Москве было организовано «депо хозяйственных семян». Оно служило посредником в обмене и распространении семян новых культур и сортов (рожь «Ваза», гималайский ячмень, сибирские пшеницы, шпергель, сахарная свекла и др.)- В первой половине XIX в. появились и оригинальные конструкции ряда сельскохозяйственных машин. Все эти вопросы становились предметом внимания сельскохозяйственной науки, которая обогащалась конкретным опытом, полученным в различных природных и экономических условиях.
Новый период в развитии русской агрономии охватывает почти всю вторую половину XIX в. Его наиболее видным представителем является И. А. Стебут.
Отмена крепостничества сильно сказалась на экономике страны и в первую очередь на ее сельском хозяйстве. Правда, процесс разложения крепостничества происходил еще до конца 80-х годов, выражаясь в постепенном развитии капиталистического земледелия, сменявшего крепостническую отработочную систему. Основные черты пореформенного развития сельского хозяйства, вскрытые В. И. Лениным в его труде «Развитие капитализма в России», заключались в развитии земледельческого капитализма, в росте товарного производства. Эти процессы сопровождались ростом производства зерновых и других культур, повышением производительности земледёлия, увеличением использования машин и применения наемного труда. Земледелие принимало все более торговый, предпринимательский характер. Не удивительно, что на русском сельском хозяйстве со значительной силой сказался мировой сельскохозяйственный кризис 1875—1894 гг. И. А. Стебут недаром сетовал по поводу спекулятивного, азартного ведения степного сельского хозяйства в России.