14 апреля после 34 часового боя, исчерпав все возможности к сопротивлению, сдался гарнизон федеральных войск форта Самтер в Южной Каролине. День атаки на этот форт, 12 апреля 1861 года, считается обычно днем начала Гражданской войны.
Северные штаты имели подавляющий перевес над южными как по населению (22 миллиона против 9 миллионов, из которых 3,5 миллиона — негры-рабы), так, и в еще большей степени, по военно-промышленному потенциалу. Если юнионисты боролись только за полную победу — уничтожение Конфедерации, то конфедераты стремились лишь к сохранению Конфедерации в существующем составе, но отнюдь не к завоеванию территории Союза.
Первое крупное сражение произошло у реки Бул-Ран в 25 милях к югу от Вашингтона 21 июля 1861 года. 33 тысячам солдат генерала-северянина Ирвина Макдоуэлла противостояли 32 тысячи конфедератов во главе с Пьером Борегаром и Джозефом Джонстоном. Две дивизии юнионистов во главе с самим Макдоуэллом перешли вброд реку и оказались в тылу неприятельского левого фланга. Их атака оказалась неожиданной, и конфедераты отступили.
Менее успешно развивалась атака через каменный мост, но и здесь южане были оттеснены от берега. Командующий Виргинской армией северян уже отправил в Вашингтон сообщение о победе. Но тут Борегар ввел в дело бригаду генерала Томаса Джексона, которая остановила прорыв на левом фланге. Генерал Б. Би смог остановить свои бегущие части, ободряя их примером Джексона: «Стойте! Стойте! Посмотрите на бригаду Джексона, она стоит непоколебимо, как каменная стена!» С тех пор Томас Джексон заслужил прозвище Каменная стена.
Натиск же северян, начавших наступление в 10 часов утра, к 2 часам дня заметно ослабел. Многие находились на ногах уже 12 часов и сильно устали во время обходного марша. В три часа дня в Манассасе выгрузилась резервная бригада южан под командованием Кэрби-Смита и немедленно контратаковала левый фланг северян, обратившийся в беспорядочное бегство к Сентервиллу. В центре северян атаковал еще один резерв конфедератов — бригада Джубала Эрли. Армия Макдоуэлла потоком хлынула к Вашингтону.
Лейтенант-юнионист Дж. Фэвилл так описал это бегство в своем дневнике. «Все было в спешке и смятении, дороги были забиты фургонами и артиллерийскими батареями, а по обе стороны от них растекались солдаты, постепенно теряя всякое подобие войск и на глазах впадая в безрассудство. Не было ни арьергарда, ни каких-либо заслонов, сдерживающих неприятеля, и он, если бы догнал нас, мог бы без труда всех взять в плен».
Беглецы бежали вплоть до пригородов американской столицы. Но южане сами были слишком утомлены боем, чтобы преследовать противника. К тому же две кадровые части в армии Макдоуэлла — пехотный батальон Сайкса и кавалерийская бригада Палмера — смогли выставить что-то вроде арьергардов и задержать конфедератов, пока не были прогнаны с поля боя кавалерийской бригадой генерала-южанина Джеба Стюарга. В этом сражении северяне потеряли 418 человек убитыми, 1011 ранеными и 1216 пропавшими без вести (почти все они оказались в плену). Потери южан составили 387 убитых, 1582 раненых и 12 пленных. В качестве трофеев войскам Борегарда и Джонстона досталось 5 тысяч винтовок, 28 орудий и полмиллиона патронов.
Макдоуэлла заменил генерал Джордж Макклеллан, ранее командовавший армией Западной Виргинии. Ему удалось собрать беглецов и укрепить армию Севера (1 ноября он был назначен главнокомандующим). Однако, как выяснилось впоследствии, в проведении боевых операций Макклеллан страдал нерешительностью и медлительностью. Борегар и Джонстон 30 сентября попытались убедить президента Конфедерации Джефферсона Дэвиса в необходимости усилить 40-тысячную армию у Манассаса 20 тысячами новобранцев и идти в поход на Вашингтон. Но Дэвис не рискнул сконцентрировать все силы на одном направлении, пусть и важнейшем. Вероятно, он был прав. После первого сражения на Булл-Ране конфедераты, безусловно, смогли бы захватить Вашингтон, но наверняка не удержали бы его, а ослабление других фронтов могло привести к печальным последствиям.
27 января 1862 года Линкольн отдал приказ о генеральном наступлении. Следуя этому приказу, армия генерала У. Гранта очистила от неприятеля штат Кентукки и стала продвигаться вглубь Теннесси. 7 апреля Грант разбил армию южан во главе с генералом А. Джонстоном у Шайло на Теннесси, причем Джонстон был смертельно ранен. Правда, убитыми и ранеными северяне в этом двухдневном сражении потеряли на 3 тысячи солдат больше, чем южане. 25 апреля пал крупнейший город Конфедерации Новый Ордеан.
Менее успешно для Союза проходила кампания в Вирджинии. Там Потомакская армия генерала Макклеллана, насчитывавшая 170 тысяч человек, собиралась захватить форт Монро на Виргинском полуострове с помощью морского десанта, но южане заранее узнали об этой операции и заранее блокировали подходы к нему. После этого в марте Макклеллан был снят с поста главнокомандующего, но остался командующим Потомакской армией. 17 марта он начал грузить свои войска на суда, чтобы высадиться на Виргинском полуострове. Отсюда он собирался атаковать столицу Конфедерации Ричмонд. Однако уже 4 апреля по приказу Линкольна из Потомакской армии был изъят 30-тысячный корпус генерала Макдоуэлла и переброшен в район Манассаса. Это было вызвано поражениями, которые нанес в долине Шендоа армии северян генерала Натаниэла Бэнкса один из лучших полководцев Конфедерации генерал Томас Джексон, получивший прозвище Каменная стена. Макдоуэлл должен был прикрыть одно из возможных направлений наступления армии Джексона на Вашингтон.
На Полуострове же Макклеллан в течение месяца не мог взять укрепленный город Йорктаун, где 15-тысячная армия южан успешно имитировала присутствие 100-тысячного войска. Тем временем Джэксон 8 мая разбил корпус Фремонта, а 23 и 25 мая еще раз одолел Бэнкса у Фронт-Ройала и Винчестера, причем у Фронт-Ройала южане потеряли 50 человек, а северяне — 904. 31 мая генерал Джонстон неудачно атаковал Макклеллана при переправе через Чикахомини, когда сам Джонстон был ранен и потерял более 6 тысяч человек (потери северян превышали 5 тысяч). После этого командование главной армией Конфедерации, действовавшей в Виргинии, принял генерал Роберт Ли.
В Семидневной битве, продолжавшейся с 26 июня по 2 июля, потери южан на 5 тысяч превысили потери северян, но Макклеллан принял решение отступить от Ричмонда и расположился лагерем в устье реки Джемс. В августе Потомакская армия была эвакуирована из Виргинии.
28–30 августа защищавшая Вашингтон Виргинская армия Джона Попа была разбита во втором сражении у Булл-Рана войсками Джексона и Ли. Северяне потеряли более 16 тысяч солдат, в том числе 6 тысяч пленными, а южане — чуть более 9 тысяч. После этого Виргинская армия была слита с Потомакской под командованием Макклеллана.
В сентябре армия Ли вторглась в штат Мэриленд и 17 сентября разбила Потомакскую армию у Шарпсберга. Исход боя решил отряд Джексона Каменная стена, который за два дня до сражения захватил главную базу северян в Харперс-Ферри, захватив 11 тысяч пленных, 13 тысяч винтовок, 73 орудия и массу продовольствия и снаряжения, а затем ударил в тыл войскам Макклеллана. Впрочем, северяне тоже объявили сражение при Шарпсберге своей победой, тем более что 19 сентября Ли отошел за Потомак.
22 сентября 1862 года Линкольн издал прокламацию об освобождении с 1 января 1863 года всех рабов, находившихся во владении участников мятежа. Освобожденные негры получили право служить в армии северян. Это позволило значительно пополнить юнионистские войска. Бывшие рабы, не обученные военному делу, использовались в основном в тыловых подразделениях, что позволило высвободить новых солдат для фронта. Ранее, 20 мая 1862 года был принят закон о гомстедах (земельных участках), согласно которому любой гражданин США мог получить во владение 160 акров (около 65 га) земли.
5 ноября 1862 года Линкольн наконец снял Джорджа Макклеллана с поста командующего Потомакской армией, обвинив его в трусости и систематической дезинформации (генерал преувеличивал как собственные успехи, так и силы противника). Но новый командующий Бернсайд потерпел поражение при Фредериксберге 12–13 декабря, потеряв в бесплодных атаках 12,7 тысячи человек против 5,3 тысячи у южан.