Когда колдовской мир вступил в войну и пошли слухи о том, что Волдеморт каким-то образом сделал себя бессмертным, Слизхорн тут же решил, что бессмертным сделал Волдеморта именно он, раскрыв ему информацию о хоркруксах (он ошибался: Риддл уже знал, как сделать хоркрукс, а знать ему нужно было лишь то, что произойдет, если сделать несколько хоркруксов). От чувства вины и страха Слизхорн заболел. Альбус Дамблдор, ставший к тому времени директором, в этот раз отнесся к своему коллеге особенно предупредительно, однако это, парадоксально, только увеличило чувство вины Слизхорна и укрепило его решимость не рассказывать о допущенной им страшной ошибке ни одной живой душе.

Во время своего первого восхождения к власти лорд Волдеморт не предпринял попытки захватить Хогвартс. Слизхорн совершенно справедливо полагал, что для него безопаснее всего будет остаться на своём посту вместо того, чтобы рисковать жить вдалеке от замка, пока Волдеморт не пойман. Когда Волдеморт встретил свой конец, атаковав младенца Гарри Поттера, Слизхорн ликовал даже больше, чем остальное колдовское население. Если Волдеморт был убит, рассуждал Слизхорн, он не мог сделать хоркруксов, что означало, что он, Слизхорн, ни в чем не виноват. Именно невероятное облегчение Слизхорна, а также его несвязные фразы, которые он обронил в первом выплеске эмоций, услышав о поражении Волдеморта, и породили в Дамблдоре подозрения, что Слизхорн мог поделиться секретами Темной магии с Томом Риддлом. Осторожные попытки Дамблдора расспросить Слизхорна, однако, заставили его замкнуться в себе. Через несколько дней Слизхорн (который к тому времени отметил полувековой юбилей работы в школе) подал в отставку.

В отставке

Хорас намеревался всецело насладиться отставкой, свободой от учительских забот и груза вины, а также страха, который жил в нем много лет. Он вернулся в комфортабельный дом своих родителей (к этому времени покойных), где он проводил школьные каникулы и где сейчас он поселился насовсем.

Почти десятилетие Слизхорн наслаждался богатым винным погребом и библиотекой, иногда навещая прежних членов "Слиз-клуба" и организуя для них вечеринки у себя дома. Однако он скучал по учительству и иногда чувствовал горький холодок от мысли, что завтрашние знаменитости, обучающиеся сейчас в Хогвартсе, не имеют ни малейшего представления о том, кто он такой.

Примерно через десять лет после ухода Слизхорна в отставку до него через его обширные знакомства дошли слухи, что лорд Волдеморт все ещё жив, хотя и живет в бестелесной форме. Именно этого Слизхорн больше всего опасался: это означало, что тот кошмарный ужас, который он испытывал так долго, имел под собой основания: Волдеморт выжил, в какой-то фрагментарной призрачной форме, потому что в юности он успешно создал один или несколько хоркруксов.

Отставка Слизхорна обернулась для него постоянным стрессом. Страдая от бессонницы и страха, он спрашивал себя, поступил ли разумно, оставив Хогвартс, куда Волдеморт в прошлый раз побоялся вторгнуться и где был Дамблдор, который наверняка лучше информирован о происходящем.

В бегах

Вскоре после завершения в Хогвартсе Тремудрого турнира (за которым Слизхорн следил по прессе с самым пристальным вниманием), колдовской мир опять захлестнула волна свежих слухов. Гарри Поттер остался в живых после состязания при подозрительных обстоятельствах, вернувшись на территорию школы, сжимая тело другого участника турнира, и заявил, что его товарищ был убит возрожденным Волдемортом.

Несмотря на то, что история Гарри широко опровергалась как Министерством магии, так и колдовской прессой, Слизхорн ей поверил. Подтверждение пришло на третью ночь после гибели Седрика Диггори: на пороге дома Слизхорна под покровом темноты объявился смертеед Корбан Яксли, явно с намерением завербовать его или силой доставить его к Волдеморту.

Слизхорн отреагировал со скоростью, которой бы подивились те, кто наблюдал, как он за годы отставки становится все жирнее и медлительнее. Превратив себя в кресло, он успешно избежал своего обнаружения Яксли. Как только смертеед покинул его дом, Слизхорн уложил в сумку самые необходимые вещи, запер дом за собой и отправился в бега.

В течение более года Слизхорн перемещался из одного жилища в другое, часто незаконно занимая магловые дома, пока их хозяева были в отъезде, потому что не смел останавливаться у друзей, которые могли бы - добровольно или под пытками - раскрыть его местонахождение. Это была тяжелая жизнь, ещё больше осложнявшаяся тем фактом, что он точно не знал, зачем понадобился Волдеморту. Он подумал, что, вполне вероятно, его бывший ученик просто хочет завербовать его в свою армию, которая все ещё была маленькой по сравнению с той, которую он имел во время предыдущего восхождения к власти; но в минуты мрачного настроения Слизхорн спрашивал себя, не хочет ли Волдеморт просто убить его, чтобы тот не раскрыл никому источник его неуязвимости.

Возвращение на учительский пост

Хотя чары и проклятия, использованные Слизхорном, позволяли ему всякий раз опережать преследовавших его смертеедов на несколько шагов, их было недостаточно, чтобы скрываться от Альбуса Дамблдора, который в итоге и обнаружил его в деревне Бадли Баббертон, где Слизхорн тайком поселился в магловом доме. Учителя не обманул камуфляж, который сработал против Яксли; Дамблдор попросил Слизхорна вернуться в Хогвартс на учительский пост. В качестве приманки Дамблдор привел с собой Гарри Поттера, с которым Слизхорн встретился в этот раз впервые: он был не только самым знаменитым студентом Хогвартса, но также и сыном одной из самых любимых учениц Слизхорна за все время, Лили Эванс.

Поупиравшись некоторое время, Слизхорн в итоге не мог совладать с двойным соблазном: получить безопасное место проживания и оказаться рядом с самим Гарри, который пользовался славой, превосходящей даже славу Тома Риддла. Слизхорн подозревал, что у Дамблдора может быть и дополнительный мотив, но он был уверен, что сможет сопротивляться попыткам Дамблдора выудить у него информацию о том, какую именно помощь тот оказал Лорду Волдеморту. Он вооружился от любой неожиданности, подготовив фальшивое "воспоминание" о той ночи, когда Риддл приблизился к нему с просьбой рассказать о хоркруксах.

Слизхорн вернулся на свой пост учителя зельеделия Хогвартса с азартом: вновь открыл "Слиз-клуб" и стал пытаться собирать под своё крыло всех самых талантливых учащихся, либо тех, у кого были наилучшие связи. Как ожидал и рассчитывал Дамблдор, Слизхорн был пленен Гарри Поттером, решив (ошибочно), что он имеет огромный талант в его предмете. Гарри, наконец, удалось выудить у Слизхорна нужную информацию о том разговоре про хоркруксы с Риддлом, использовав против него его же собственное зелье, феликс-фелицис, который сделал Гарри невероятно везучим.

Хогвартс под властью смертеедов

Как только школа была захвачена Лордом Волдемортом, с Северусом Снейпом в качестве директора и смертеедами Карроу на ключевых позициях с целью подчинения персонала и учащихся, Слизхорн узнал, что Волдеморт не хочет от него ничего, кроме как остаться на своём посту и учить чистокровных и полукровок. Так он и поступил: держась тише воды ниже травы, но никогда не прибегая к насилию в отношении учащихся, которое насаждали Карроу, и пытаясь заботиться о находящихся на его попечении учащихся по мере сил.

Битва при Хогвартсе

Поведение Слизхорна во время самой опасной ночи его жизни показало, чего по-настоящему стоит этот человек. Вначале он, кажется, самоустранился от сражения, выведя слизеринцев из замка в безопасность. Но, оказавшись в Хогсмиде, он помог поднять и мобилизовать деревенских жителей, а потом вместе с Чарли Уизли вернулся в школу во главе колонны подкрепления в переломный момент битвы. Более того: он был одним из трех последних колдунов (вместе с Минервой Макгонаголл и Кингсли Шаклболтом), которые сражались с Волдемортом перед его последним столкновением с Гарри. Слизхорн хотел искупить свою вину такими храбрыми действиями, рискуя жизнью, сражаясь со своим бывшим учеником.