Ñïóñòÿ òðè ãîäà ïî ïðèáûòèè â Õåðñîíåñ Ìèëüòèàä, âìåñòå ñî âñåìè ñîñåäíèìè ãðå÷åñêèìè ãîðîäàìè, äîëæåí áûë ïîä÷èíèòüñÿ âëàñòè ïåðñèäñêîãî öàðÿ Äàðèÿ, øåäøåãî ïðîòèâ ñêèôîâ, è ñîïðîâîæäàòü åãî ôëîò ñî ñâîèìè êîðàáëÿìè. Ìèëüòèàä áûë â ÷èñëå òåõ òèðàíîâ, êîòîðûå îõðàíÿëè ìîñò íà Äóíàå, è áîëåå äðóãèõ ãîâîðèë çà ðàçðóøåíèå ìîñòà è çà óíè÷òîæåíèå ïåðñèäñêîé àðìèè. Ãèñòèåé Ìèëåòñêèé, êîòîðûé òîãäà ñïàñ öàðÿ, êîíå÷íî, ïîñïåøèë âûñòàâèòü ïåðåä öàðåì ñâîè ñîáñòâåííûå çàñëóãè è îòêðûòü åìó èçìåíó Ìèëüòèàäà. Ñ òåõ ïîð âëàñòü Ìèëüòèàäà áûëà íåíàäåæíà. Íî ïðåæäå âñåãî îí äîëæåí áûë ïîêèíóòü ñâîþ ñòðàíó ïåðåä ñêèôàìè, êîòîðûå, ïðåñëåäóÿ Äàðèÿ, ïðîíèêëè â Õåðñîíåñ è íà íåêîòîðîå âðåìÿ ïðåêðàòèëè ïåðñèäñêîå ãîñïîäñòâî âî Ôðàêèè.
Òîò÷àñ æå ïîñëå íàøåñòâèÿ ñêèôîâ Ìèëüòèàä ñíîâà âîçâðàòèëñÿ â Õåðñîíåñ è ñíîâà óòâåðäèë òàì ñâîþ âëàñòü. Îí èñêàë ñåáå ñîþçíèêà â ñîñåäíåì ôðàêèéñêîì ïðåäâîäèòåëå Îëîðå, íà äî÷åðè êîòîðîãî è æåíèëñÿ. Îò ýòîãî âòîðîãî áðàêà ðîäèëñÿ Êèìîí. Âðåìÿ Èîíèéñêîãî âîññòàíèÿ, êîãäà ïåðñèäñêîå âëàäû÷åñòâî â Ýãåéñêîì ìîðå ïðåêðàòèëîñü, Ìèëüòèàä óïîòðåáèë íà çàâîåâàíèå îòïàâøåãî îò ïåðñîâ Ëåìíîñà; îí ïåðåäàë îñòðîâ ñâîåìó îòå÷åñòâåííîìó ãîðîäó, Àôèíàì, â òîì óáåæäåíèè, ÷òî ñîáñòâåííûìè ñâîèìè ñèëàìè íå â ñîñòîÿíèè áóäåò çàùèòèòü åãî îò ïåðñîâ. Íî êîãäà ïîñëå ïàäåíèÿ Ìèëåòà, â 494 ãîäó, ïåðñèäñêèé ôëîò îáðàòèëñÿ íà ñåâåð Ýãåéñêîãî ìîðÿ, ê Ãåëëåñïîíòó, Ìèëüòèàä äîëæåí áûë ïîäóìàòü è î ñîáñòâåííîì ñïàñåíèè.  Êàðäèè îí íàãðóçèë âñåìè ñâîèìè ñîêðîâèùàìè ïÿòü òðåõâåñåëüíûõ ñóäîâ è áåæàë â Àôèíû. Äîðîãîé îí íàòêíóëñÿ â Èìáðîñå íà íåïðèÿòåëüñêèé ôëîò; ñàì Ìèëüòèàä ñ ÷åòûðüìÿ ñóäàìè óøåë, íî ïÿòûé êîðàáëü, íà êîòîðîì íàõîäèëñÿ åãî ñòàðøèé ñûí Ìåòèîõ, áûë çàõâà÷åí ôèíèêèÿíàìè. Ìåòèîõ ïðåäñòàâëåí áûë ê öàðþ Äàðèþ, êîòîðûé, îäíàêî æå, íå ñäåëàë åìó íè÷åãî õóäîãî, à íàïðîòèâ, ïîäàðèë åìó äîì è ïîìåñòüå è æåíèë íà ïåðñèÿíêå.
Êîãäà Ìèëüòèàä âîçâðàòèëñÿ â Àôèíû, èìåÿ áîëåå 60 ëåò, íî åùå áîäðûé è êðåïêèé, òîãäàøíèå ïðàâèòåëè ãîñóäàðñòâà, Êñàíòèïï, ñûí Àðèôðîíà, îòåö Ïåðèêëà, Àðèñòèä, ñûí Ëèñèìàõà, è äðóãèå ñòàëè ñìîòðåòü íà íåãî ïîäîçðèòåëüíî. Ðîä Ôèëèäîâ èìåë â Àòòèêå îáøèðíûå âëàäåíèÿ, ñàì Ìèëüòèàä âîçâðàòèëñÿ ñ îãðîìíûìè áîãàòñòâàìè, áûë ïîïóëÿðåí çà ïåðåäà÷ó ãîðîäó îñòðîâà Ëåìíîñà, èçâåñòåí ñâîèìè òèðàíè÷åñêèìè ñòðåìëåíèÿìè è ñâîåé ðåøèòåëüíîñòüþ. Íå ñëåäîâàëî ëè îïàñàòüñÿ, ÷òî ÷åëîâåê, ïðèâûêøèé ê íåîãðàíè÷åííîé âëàñòè, îïèðàÿñü íà ñâîå áîãàòñòâî, áóäåò óãðîæàòü ñâîáîäå è ñïîêîéñòâèþ ãîñóäàðñòâà? Âðàãè ïðèâëåêëè Ìèëüòèàäà ê ñóäó çà òî, ÷òî îí â Õåðñîíåñå òèðàíè÷åñêè îáðàùàëñÿ ñ àôèíÿíàìè. Íî íàðîäíûé ñóä îïðàâäàë çàâîåâàòåëÿ Ëåìíîñà. Òàêèì îáðàçîì, Ìèëüòèàä ñïîêîéíî îñòàëñÿ â Àôèíàõ — íå äëÿ òîãî, ÷òîáû ïîä÷èíèòü àôèíÿí òèðàíè÷åñêîìó ÿðìó, íî ÷òîáû ñâåðãíóòü ñ íèõ è ñî âñåé Ãðåöèè ÷óæåçåìíîå èãî, êîòîðûì óæå ãðîçèëè ïåðñû. Ïî ïðåêðàùåíèè Èîíèéñêîãî âîññòàíèÿ Äàðèé ðåøèëñÿ óâåëè÷èòü àðìèþ, óñìèðèâøóþ àçèàòñêèõ ãðåêîâ, è ïîä÷èíèòü ñâîåé âëàñòè Ôðàêèþ, Ìàêåäîíèþ è Åâðîïåéñêóþ Ãðåöèþ, â îñîáåííîñòè æå îòìñòèòü æèòåëÿì Ýðåòðèè è Àôèí, êîòîðûå îñìåëèëèñü áûëî ïåðåíåñòè îðóæèå â åãî ãîñóäàðñòâî. Êîãäà Äàðèþ äîíåñëè, ÷òî àôèíÿíå âìåñòå ñ èîíÿíàìè ñîæãëè Ñàðäû, îí íàòÿíóë ëóê è ïóñòèë ñòðåëó ââåðõ, ñêàçàâ: «Î Çåâñ, äàé ìíå îòìñòèòü àôèíÿíàì!» Òîãäà æå îí îòäàë ïðèêàç ñâîåìó ñëóãå êàæäûé äåíü, ëèøü òîëüêî îí ñòàíåò ñàäèòüñÿ çà ñòîë, òðîåêðàòíî ïîâòîðÿòü: «Ãîñóäàðü, ïîìíè àôèíÿí!» Êðîìå òîãî, Èïïèÿ, ïðèáûâøèé èç Ñèãåéîíà â Ñàðäû êî äâîðó Àðòàôåðíà, óæå öåëûé ãîä âîçáóæäàë ïåðñèäñêîãî öàðÿ ïðîòèâ Àôèí, èìåÿ â âèäó ñ ïîìîùüþ ïåðñîâ ñíîâà ñäåëàòüñÿ òèðàíîì.
Äàðèé ïîðó÷èë ãëàâíîå íà÷àëüñòâî íàä ìîðñêèìè è ñóõîïóòíûìè ñèëàìè, êîòîðûå ïðåäíàçíà÷àëèñü äëÿ çàâîåâàíèÿ Åâðîïû, Ìàðäîíèþ, ìîëîäîìó ÷åëîâåêó è áëèçêîìó ñâîåìó ðîäñòâåííèêó. Îí áûë çÿòü öàðÿ è íåçàäîëãî ïåðåä ýòèì æåíèëñÿ íà åãî äî÷åðè Àðòàçîñòðå.  493 ãîäó èç Ãåëëåñïîíòà äâèíóëèñü ñóõîïóòíàÿ àðìèÿ è ôëîò, ÷òîáû ïîäíÿòü ïðîòèâ Ãðåöèè Ôðàêèþ è Ìàêåäîíèþ. Íî ôëîò, âñëåäñòâèå ÷ðåçâû÷àéíî ðàíî íàñòóïèâøåé è æåñòîêîé çèìû ñ 493 íà 492 ãîä, ïîòåðïåë ñòðàøíîå êðóøåíèå ïðè ìûñå Àôîíñêîì, ïðè÷åì ïîãèáëî 300 êîðàáëåé è 20000 ÷åëîâåê.  òî æå âðåìÿ ñóõîïóòíàÿ àðìèÿ, ïðè êîòîðîé íàõîäèëñÿ Ìàðäîíèé, ïîäâåðãëàñü â Ìàêåäîíèè íàïàäåíèþ ôðàêèéñêîãî ïëåìåíè âðèãîâ è áûëà îò÷àñòè èñòðåáëåíà; ñàì Ìàðäîíèé áûë ðàíåí. Ïîñëå ñòðàøíûõ ïîòåðü Ìàðäîíèé íå îòâàæèëñÿ èäòè äàëüøå â òàêîå äóðíîå âðåìÿ ãîäà â òàêîì ñóðîâîì êëèìàòå; îí îòâåë âîéñêî è ôëîò â Àçèþ, è Àôèíû áûëè íà ýòîò ðàç ñïàñåíû. Ìàðäîíèé âïàë ó öàðÿ â íåìèëîñòü, õîòÿ åãî çàâîåâàíèÿ âî Ôðàêèè è Ìàêåäîíèè áûëè äîâîëüíî çíà÷èòåëüíû è, ïîêà Äàðèé áûë æèâ, íå òðåáîâàëè íîâûõ âîåííûõ ïðåäïðèÿòèé.
Äàðèé, îäíàêî æå, íå ïîêèäàë ñâîèõ ïëàíîâ îòíîñèòåëüíî Ãðåöèè.  491 ãîäó âñå ïðèìîðñêèå ãîðîäà ïåðñèäñêîãî öàðñòâà ïîëó÷èëè ïîâåëåíèå ïðèãîòîâèòü ñâîè âîåííûå ñóäà è ïîñòðîèòü òðàíñïîðòíûå äëÿ ëîøàäåé. Âî èçáåæàíèå òðóäíîñòåé è îïàñíîñòåé íà ñåâåðíîì ìîðå òåïåðü ïðåäïîëàãàëîñü ïëûòü îò àçèàòñêèõ áåðåãîâ ïî Ýãåéñêîìó ìîðþ, ìèìî Êèêëàäñêèõ îñòðîâîâ, ïðÿìî ê Ýâáåå è Àòòèêå, è äîðîãîé ïîêîðèòü Êèêëàäû. Íî ïðåäâàðèòåëüíî Äàðèé îòïðàâèë ïîñëîâ íà îñòðîâà è åâðîïåéñêèé ìàòåðèê ñ ïðèêàçàíèåì òðåáîâàòü çåìëè è âîäû, â çíàê ïîä÷èíåíèÿ. Æèòåëè îñòðîâîâ äàëè çåìëþ è âîäó; òî æå ñäåëàëè è ìíîãèå ãîðîäà íà ìàòåðèêå; íî ðàçäðàæåííûå ñïàðòàíöû áðîñèëè ïåðñèäñêèõ ïîñëîâ â êîëîäåçü, íàñìåøëèâî ïðèáàâèâ, ÷òî çäåñü îíè íàéäóò äëÿ ñåáÿ è çåìëþ, è âîäó, à àôèíÿíå, ïî ïðåäëîæåíèþ Ìèëüòèàäà, ñâåðãëè èõ â Âàðàôðîí — ïðîïàñòü, â êîòîðóþ îáûêíîâåííî áðîñàëè ïðåñòóïíèêîâ! Òàêîå íàðóøåíèå ìåæäóíàðîäíîãî ïðàâà ïîâåëî ê ðàçðûâó ñ ïåðñàìè.
Ïåðñèäñêèé ôëîò, êîòîðûé äîëæåí áûë ïðèíÿòü íà ñåáÿ ñóõîïóòíóþ àðìèþ ñ áåñ÷èñëåííîé êîííèöåé, ñîáðàëñÿ âåñíîé 490 ãîäà â Êèëèêèè.  íåì áûëî 600 òðåõâåñåëüíûõ ñóäîâ. Âî ãëàâå âîéñêà Äàðèé ïîñòàâèë Àðòàôåðíà, ìåíüøåãî ñûíà ñâîåãî áðàòà Àðòàôåðíà, íàìåñòíèêà Ñàðä, à â ñîâåòíèêè åìó íàçíà÷èë ïîæèëîãî ÷åëîâåêà èç Ëèäÿí, ïî èìåíè Äàòèñ. «Èäèòå íà Ãðåöèþ, — ãîâîðèë èì Äàðèé, — ïîðàáîòèòå ýòèõ óïðÿìöåâ è ïðèâåäèòå èõ êî ìíå». Ôëîò äâèíóëñÿ îò Ñàìîñà ÷åðåç Êèêëàäû. Íàêñîñ, òàê õðàáðî âûäåðæàâøèé ïðåæäå íàïàäåíèå ïåðñèäñêîãî ôëîòà, ïîä íà÷àëüñòâîì Àðèñòàãîðà, áûë îïóñòîøåí, à ãîðîä åãî áûë ïðåäàí îãíþ; íàïðîòèâ òîãî, Äåëîñ, îñòðîâ ëó÷åçàðíîãî Àïîëëîíà, áûë ïîùàæåí è äàæå óäîñòîèëñÿ ïî÷åñòåé, ïîòîìó ÷òî ïåðñû ñ÷èòàëè ñâåò âåðõîâíûì áîæåñòâîì. Îñòàëüíûå îñòðîâà áûëè íàêàçàíû, è ôëîò íàïðàâèëñÿ ê Ýðåòðèè.  òå÷åíèå øåñòè äíåé ñòåíû ãîðîäà áåçóñïåøíî áûëè øòóðìîâàíû; íà ñåäüìîé äåíü äâà çíàòíåéøèõ ÷åëîâåêà, Ýâôîðá è Ôèëàãð, ïðåäàëè ñâîé îòå÷åñòâåííûé ãîðîä âàðâàðàì. Îí áûë ðàçãðàáëåí è ñîææåí, îñòàòîê æèòåëåé îáðàùåí â ðàáñòâî.
Îòïðàâèâ ïëåííûõ è ðàíåíûõ ýðåòðèéöåâ íà ìàëåíüêèé îñòðîâ Ýãèëåþ â Ýâáåéñêîì ïðîëèâå, ïåðñèäñêîå âîéñêî, ðóêîâîäèìîå Èïïèåé, âûñàäèëîñü íà áåðåã Àòòèêè, â Ìàðàôîíñêîì îêðóãå, íåñêîëüêî â ñòîðîíå îò Ýâáåè.  Ìàðàôîíñêîì îêðóãå Ïèñèñòðàòèäû èìåëè íåêîãäà ñàìûõ âåðíûõ ïðèâåðæåíöåâ, è Èïïèÿ ðàññ÷èòûâàë, ÷òî ê íåìó íåìåäëåííî ïðèñîåäèíÿòñÿ âñå è ÷òî îí, êàê òî áûëî 48 ëåò òîìó íàçàä, ïðè åãî îòöå, áûñòðî è ïîáåäîíîñíî ïðîéäåò îòñþäà â Àôèíû. Êàê òîëüêî êîðàáëè ïðèñòàëè ê áåðåãó, àðìèÿ òîò÷àñ æå íàøëà ìåñòî, óäîáíîå äëÿ ëàãåðÿ è äëÿ òîãî, ÷òîáû âûòàùèòü ñóäà íà ñóøó. Àðòàôåðí ðàçáèë ñâîþ ïàëàòêó íà âîçâûøåííîñòè, ó ìîðñêîãî áåðåãà, â ñåâåðíîì óãëó Ìàðàôîíñêîé ðàâíèíû, îòêóäà ìîæíî áûëî ñðàçó îáîçðåòü âñå ïîëå.
Ñòîòûñÿ÷íàÿ àðìèÿ ñòðàøíîãî âîèíñòâåííîãî íàðîäà ðàñïîëîæèëàñü ëàãåðåì íà àòòè÷åñêîé çåìëå è îïóñòîøàëà áåðåãà ââåðõ äî ñàìîé Âèîòèè; áåæàâøèå ïîñåëÿíå òîëïàìè óñòðåìèëèñü â ãëàâíûé ãîðîä, ðàñïðîñòðàíÿÿ ïîâñþäó ñìÿòåíèå è óæàñ. Íî î ïåðåãîâîðàõ, î ïîä÷èíåíèè íå äóìàë íèêòî; áûëî ðåøåíî çàùèùàòü ñâîáîäó è îòå÷åñòâî äî ïîñëåäíåé êðàéíîñòè, õîòÿ íåëüçÿ áûëî ðàññ÷èòûâàòü íà êàêóþ áû òî íè áûëî ïîääåðæêó îò áëèæàéøèõ ñîñåäåé, êîòîðûå îò÷àñòè äàæå äåðæàëè ñòîðîíó ïåðñîâ; ïîìîùü Ñïàðòû áûëà äàëåêà è ñîìíèòåëüíà. Ñïàñåíèå íóæíî áûëî îæèäàòü îò ñîáñòâåííîé õðàáðîñòè, áëàãîðàçóìèÿ è åäèíîäóøèÿ ëþäåé, ñòîÿâøèõ âî ãëàâå âîéñêà. Äåñÿòü ñòðàòåãîâ èëè ïðåäâîäèòåëåé, âûáèðàåìûõ åæåãîäíî èç 10 ôèë, ñîñòàâëÿëè âìåñòå ñ àðõîíòîì-ïîëåìàðõîì — ãëàâíîêîìàíäóþùèì — âîåííûé ñîâåò, ïðè÷åì êàæäûé ïðåäâîäèòåëüñòâîâàë ãîïëèòàìè ñâîåé ôèëû.  ÷èñëå òàêèõ ïðåäâîäèòåëåé â íàñòîÿùåì ãîäó áûëè ëó÷øèå èç àôèíÿí — Êàëëèìàõ (îí áûë ïîëåìàðõîì), Àðèñòèä, Ôåìèñòîêë, Ñòåñèëàé, Ìèëüòèàä. Íà Ìèëüòèàäà â íàñòîÿùèõ çàòðóäíèòåëüíûõ îáñòîÿòåëüñòâàõ îáðàùåíû áûëè âñå âçîðû. Îí áûë èçâåñòåí çà ÷åëîâåêà âåëèêîé îïûòíîñòè, çà õðàáðîãî è óìíîãî ïðåäâîäèòåëÿ; â ïðåæíåå âðåìÿ îí èìåë äîñòàòî÷íî ñëó÷àåâ îçíàêîìèòüñÿ ñ îáðàçîì âîéíû è ñ âîîðóæåíèåì ïåðñèäñêîé àðìèè; ïðèòîì îí óæå äîêàçàë íà Äóíàéñêîì ìîñòó, äî êàêîé ñòåïåíè áûëà áëèçêà åãî ñåðäöó ñâîáîäà ãðåêîâ è åãî îòå÷åñòâà. Ìèëüòèàä áûë æåñòîêèì âðàãîì ïåðñîâ è ïðèâåçåííîãî èìè Èïïèè; ïîñëå ñâîåãî ïîñòóïêà íà ìîñòó, ïîñëå çàâîåâàíèÿ Ëåìíîñà, êîòîðûì âëàäåëè ïåðñû, ïîñëå óìåðùâëåíèÿ; ïåðñèäñêèõ ïîñëîâ, îí íå ìîã îæèäàòü äëÿ ñåáÿ îò âàðâàðîâ íè÷åãî õîðîøåãî. Ìèëüòèàä áûë çà áîðüáó äî ïîñëåäíåé êðàéíîñòè; îí íàäåÿëñÿ, ÷òî ãðå÷åñêîå ìóæåñòâî ïîáåäèò äèêèå ïîë÷èùà àçèàòöåâ, è åãî ðåøèòåëüíîñòü, åãî óâåðåííîñòü íàïîëíÿëè ðàäîñòüþ ñåðäöà àôèíÿí.