Болбочан приказал Волоху, полк которого тогда стоял в Бахмуте, начать переговоры с командирами донских казаков. Но тот категорически отказался выполнить приказ в силу своей «революционной сознательности». Отказ командира полка подчиняться вызвал резкую реакцию Болбочана: он заявил, что Волох — «большевик» и подлежит аресту. Но сделать это было не просто. Волох уже стал атаманом, его окружали преданные бойцы, спаянные боями и реквизициями, любившие своего командира за то, что он закрывал глаза на многое. Волох пытался утвердить свою власть в районе Луганска, где был расквартирован его 3-й гайдамацкий полк.

А между тем Красная армия, захватив в январе 1919 года Харьковщину, вынудила части Болбочана отойти на Полтаву. 3-й полк с боями пробился через махновский район и отошел к Кременчугу, где Волох арестовал главкома Болбочана. Задержанный был переправлен в Киев, в распоряжение Петлюры.

Уже в советское время Волох говорил об аресте реакционера Болбочана как о своей главной заслуге перед революцией. Он утверждал, что к аресту Болбочана его подтолкнуло стремление предотвратить «сползание» к реакции, заявлял, что «...сам, исходя из своих убеждений, арестовал Болбочана» и что «арест был произведен в связи с неудачами Под Полтавой, а также недоверием запорожских войск к нему [Болбочану. — В. С.] за его ориентацию на Дон».

После ареста Болбочана Волох занял должность арестованного — командира Запорожского корпуса. Но через несколько дней после нового назначения он заболел тифом и на полтора месяца выбыл из строя. Продолжительная болезнь Волоха поставила Запорожский корпус на грань краха. Корпус (которым временно командовал атаман Данченко) не смог сдержать наступление красных на рубежах Днепра и отступил в северные районы Херсонщины.

В середине марта 1919 года Волох вернулся к командованию Запорожским корпусом. За время болезни он решил перейти на сторону победителей или стать независимым атаманом. К тому же 1-я советская армия Украинского фронта ударом на Жмеринку отрезала Запорожский корпус от основной массы войск УНР. Для Волоха выход был уже ясен — перейти, по примеру атамана Григорьева, на сторону красных. Он организовал в своем корпусе ревком Южной группы войск УНР, которым номинально руководил большевик Рыбик. Ревком заявил о своей поддержке Украинской советской республики и объявил о союзе с Красной армией. Волох уже видел себя командующим всех большевистских украинских частей, однако командующий Антонов-Овсеенко вовсе не горел желанием уступать ему свой пост.

Волох стремился к переговорам на высшем уровне — с СНК Советской Украины. Он был согласен принять в свои части комиссаров, предлагал поставить военную задачу его корпусу. 21 марта 1919 года Волох распространил среди солдат Запорожского корпуса универсал с призывом перейти на сторону Красной армии и поддержать советскую власть в Украине. Чтобы повести «запорожцев» за собой, ему пришлось обманывать своих подчиненных. Он заявил, что получил информацию о перевороте в украинских войсках и в Директории, об аресте Петлюры, о присоединении украинских войск к Красной армии. Выдавая себя за большевика, он «признался», что сам хотел еще два месяца назад арестовать Петлюру и перейти к красным.

Волох связался с украинскими эсерами и независимыми украинскими социал-демократами из Вапнярского ревкома, стремившегося утвердить себя еще одним «правительством» Украины и объявить войну Директории. Но неожиданно для Волоха ревком избрал командующим своим «советским войском» — Запорожским корпусом — Федора Колодия, дворянина и царского генерала.

Волох назвал Колодия «скрытым белогвардейцем», который хочет сдать корпус в плен интервентам. Эти интриги Волоха принесли желаемый результат: Колодий был отстранен от командования, и Волох вернул себе власть над «Советским Запорожским войском». Под страхом расстрела он принудил офицеров корпуса подписать универсал о союзе с Красной армией. Через несколько дней выяснилось, что советское руководство и не собиралось принимать в расчет атаманское «раскаяние» и заверения Волоха в преданности. Командование Красной армии предложило, без каких-либо условий, сдать все оружие корпуса, сменить командный состав и развести «запорожцев» по отдельным соединениям.

В эти дни Волох потерял самообладание, думая, что красные его расстреляют. Бросив корпус, он уехал в Бирзулу (ныне — Котовск), надеясь договориться о союзе с французскими частями, увести корпус в занятую французами Одессу. Волох успел вывести части на одесское направление, однако с севера, востока и юга все пути были перекрыты большевиками. Сильный заслон красных у станции Раздельная и сообщение о захвате атаманом Григорьевым Одессы вынудили окруженных повернуть на Тирасполь. Развал Днепровского и Южного фронтов армии УНР в январе-марте 1919 года был делом рук атаманов Григорьева, Божко и Волоха, которые хотели купить себе «гетманскую булаву» у большевиков.

В Раздельной Волоха арестовала отдельная группа украинских войск во главе с атаманом Трифоном Янивым. Этот атаман, решив заманить Волоха в расположение своей группы, заявил, что поддерживает волоховский универсал. Явившийся к «союзнику» на переговоры Волох был арестован и вскоре предстал перед судом украинских командиров. Его сняли со всех должностей и вынудили подписать обязательство больше не вмешиваться в военные и политические дела.

Единственный путь спасения Запорожского корпуса вел на запад, к румынской границе. В апреле 1919 года новый командир Дубовой вывел остатки корпуса через Румынию на Подолье, где находились войска Петлюры. Румынские власти пропустили 8 тысяч «запорожцев» через Молдавию, предоставив им 80 железнодорожных эшелонов. Между тем разжалованный в простые гайдамаки Волох не унимался и призывал «запорожцев» не переходить в Румынию, обвинял Дубового в связях с «румынской буржуазией», ратовал за сотрудничество с Красной армией.

Несмотря на предательство Волоха, Петлюра не только освободил его из-под ареста, но и предложил ему возглавить 6-ю (1-ю Запорожскую) дивизию. Глава Директории по-прежнему считал Волоха своим личным другом и способным организатором, правда, иногда заблуждавшимся. Узнав об этом назначении, офицеры-«запорожцы» подняли мятеж, угрожая убить Волоха. Не дожидаясь самосуда, бросив пост комдива, тот бежал из Почаева (где размещалась дивизия) в Каменец-Подольский и «выбил» у Петлюры новое высокое назначение — главкома повстанческих войск Украины. Это было губительное для повстанчества назначение, так как Волох не мог ужиться с многочисленными партизанскими атаманами, особенно с такими влиятельными, как Тютюнник и Зеленый. При покровительстве Петлюры Волох попытался создать повстанческую дивизию, получившую название Вторая Запорожская Сечь.

В конце мая 1919 года Волох тайно приехал в Киев. Там он был арестован ЧК, но при загадочных обстоятельствах бежал из тюрьмы и вернулся в расположение петлюровского войска. Возможно, Волох купил себе свободу обещанием сотрудничества с ЧК. Позднее он писал, что уже тогда, «прячась, читал большевистскую литературу», потому и утвердился в мысли о правоте большевиков и вернулся в войска Петлюры с твердым намерением поднять восстание против Директории. Оказавшись снова в армии УНР, Волох обратился к бывшим «запорожцам», призвав их покинуть войска Директории и присоединиться к «левым» повстанцам. Это был второй бунт Волоха против своего покровителя.

Взбунтовавшиеся гайдамаки убили командира полка Виноградова, который пытался воспрепятствовать измене. Между частями армии УНР вспыхнуло настоящие сражение. «Левые» гайдамаки воевали против «правых запорожцев» и стрельцов. Чтобы не допустить крушения фронта, Петлюра решил уладить дело миром. Он выделил из других формирований армии бывших красных гайдамаков и возродил 3-й гайдамацкий полк. Вскоре этот полк был назван бригадой, которую возглавил атаман Волох. Гайдамаки Волоха были поставлены в привилегированное положение личной гвардии Петлюры и пользовались всеми преимуществами тыловой, сытой жизни.