Так как большая часть американского Тихоокеанского флота постоянно находилась на якорных стоянках Пирл-Харбора, немедленно начали разрабатываться планы внезапной атаки. Более тщательное изучение Пирл-Харбора проводилось сотрудниками японского консульства в Гонолулу. Военно-морская разведка в Токио получала их еженедельные отчеты о кораблях на стоянках и в море. В сентябре бухта Кагосима была выбрана в качестве секретного места отработки атаки Пирл-Харбора. Началось производство торпед со специальными деревянными плавниками, приспособленными для использования на мелководье Пирл-Харбора.

K 3 ноября адмирал Ямамото подавил все сопротивление внутри флота. Было решено, что флот нанесет внезапный удар по Пирл-Харбору, если политики и дипломаты не сумеют договориться. 5 ноября старшие офицеры получили совершенно секретный Оперативный приказ № 1. “На востоке следует уничтожить американский флот. Следует перерезать американские операционные линии, и линии снабжения на Дальнем Востоке. Вражеские силы следует перехватывать и уничтожать. Победы следует использовать, чтобы сокрушить волю противника к сопротивлению”. 11 ноября аналогичный приказ получил вице-адмирал Нагумо, командующий Первым Воздушным Флотом и общий командующий Ударным Соединением Пирл-Харбор. Немного позднее, 25 ноября, он получил приказ выйти в море на следующий день. Ни первоначальный приказ, ни более детальный приказ № 9, переданный на все корабли соединения Нагумо, даже не упоминали об ударе по нефтехранилищу или ремонтным мастерским. Тогда этому не придавали значения.

Адмирал Нагумо, который считался грубым и необщительным человеком, был верховным командующим японскими авианосными силами. Он не верил в успех удара по Пирл-Харбору, постоянно напоминая Ямамото (с которым был в не самых лучших отношениях), что авианосец — очень уязвимая цель. Хотя его самолеты способны нанести врагу серьезные потери, вражеские самолеты могут потопить авианосец одной-двумя метко нацеленными бомбами или торпедами. Нагумо был сторонник удара в южном направлении, но в конце лета 1941 года он неохотно принял идею налета на Пирл-Харбор.

22 ноября оперативное соединение начало собираться на одном из Курильских островов в бухте Танкан (также называемой Хитокаппу). Удар по Пирл-Харбору был назначен на 8.30 воскресенья 7 декабря. Японцы постарались окружить свои приготовления завесой самой строгой секретности. Для того, чтобы скрыть сбор Ударного Соединения, корабли во Внутреннем море организовали ложный радиообмен. Это могло заставить американскую разведку поверить, что японские авианосцы находятся в отечественных водах. Действительно, американская разведка потеряла японские авианосцы. И среди предположений, куда они все-таки могут направляться, Пирл-Харбор не фигурировал.

Адмирала Ямамото 25 ноября приказал Ударному Соединению выходить на следующее утро. Оно должно было 3 декабря заправиться в море с танкеров в намеченной заранее точке. Если не будет получен приказ отменить атаку, наносить удар, как намечалось. После этого отходить на запад, чтобы не попасть под ответную атаку, и возвращаться в Японию.

Соединение Нагумо покинуло бухту Танкан в густом тумане. Авианосцы вышли в море в 9.00 26 ноября. Курс был проложен через пустынные районы северной части Тихого океана. В случае обнаружения, соединению было приказано возвращаться. Однако плохая погода — дожди, туманы и постоянные зимние шторма — помогли ему избежать обнаружения, хотя серьезно затрудняла сохранение строя. В авангарде, в качестве прикрытия, шли эсминцы и легкий крейсер. За ними двигались тяжелые крейсера, шедшие на траверзах тяжелых авианосцев. Те были выстроены в 2 колонны по 3 корабля. Замыкали строй линкоры.

Первый Воздушный Флот:

Тяжелые авианосцы: Акаги, Кага, Хирю, Сорю, Сёкаку, Дзуйкаку

Легкий крейсер: Абукума

Эсминцы: Исокадзэ, Уракадзэ, Таникадзэ, Хамакадзэ, Арарэ, Касуми, Кагэро, Сирануи, Акигумо

Соединение Поддержки:

Линкоры: Хиэй, Кирисима

Тяжелые крейсера: Тонэ, Тикума

Разведывательный Отряд:

Подводные лодки: I-19, I-21, I-23

Отряд Обстрела Мидуэя:

Эсминцы: Усио, Сазанами

Соединение Снабжения:

8 танкеров и судов снабжения

1 декабря было принято решение начать войну. Поэтому 2 декабря адмиралу Нагумо было отправлено кодовое сообщение, приказывающее атаковать: “Ниитака яма ноборо — Начинайте восхождение на гору Ниитака”. Теперь только преждевременное обнаружение могло сорвать атаку. 3 декабря ветер немного стих, что позволило провести дозаправку больших трудностей. Море немного успокоилось, и соединение, которое до этого шло с экономической скоростью 13 узлов, увеличило скорость до 26 узлов, чтобы выйти в точку подъема самолетов к намеченномy времени. Однако туман был по-прежнему густым.

На борту “Акаги” адмирал Нагумо беспокоился, как бы его не обнаружили раньше времени. Его также мучил вопрос: а будет ли американский флот в гавани в день атаки? Нагумо надеялся захватить авианосцы на якорной стоянке. Когда он покидал бухту Танкан, то считал, что на Тихом океане находятся 6 американских авианосцев, которые могут оказаться в Пирл-Харборе. Позднее он получил информацию, что “Саратога” стоит в Сан Диего. Японская разведка так и не узнала, что в это время “Хорнет” и “Йорктаун” находились в Атлантике. Вечером 6 декабря он узнал самое скверное: по последним данным в Пирл-Харборе не было ни одного авианосца! Для командира, который считал авианосцы гораздо важнее линкоров, это был страшный удар. Эта новость не повлияла на исход намеченной атаки, но оказала сильное влияние на стратегическое значение этой атаки для Японии. Постоянное прослушивание радиопереговоров американской авиаразведки показало, что она ориентирована на юго-запад, и точка взлета самолетов в сектор поисков не попадала. Когда Нагумо подошел к Оаху, коммерческие радиостанции вели обычные передачи. Никаких признаков беспокойства, японцев так и не обнаружили.

Вечером 6 декабря погода ухудшилась. Возникли опасения, а смогут ли стартовать самолеты? В 21.00, когда соединение находилось в 400 милях от Пирл-Харбора, адмирал Нагумо объявил общее построение личного состава по флоту. Был зачитан приказ адмирала Ямамото:

“Взлет или падение империи зависят от этой битвы. Каждый должен выполнить свой долг”. Это был парафраз знаменитого приказа Нельсона перед Трафальгаром, повторенного адмиралом Того перед Цусимой. Для поднятия духа на мачту “Акаги” взлетел флаг адмирала Того, развевавшийся над “Микасой” 36 лет назад. Соединение шло на S со скоростью 26 узлов. Самолеты предполагалось поднять в точке 26° N, 158' W. Пирл-Харбор находился в 275 милях прямо на юге.

Конечно, Ударное Соединение наносило удар по Пирл-Харбору не в одиночку. Начиная с 10 ноября базы в Йокосуке и Курэ покинуло передовое соединение из 27 подводных лодок. 11 субмарин типа “I” несли маленькие разведывательные гидросамолеты. Еще 5 подводных лодок — I-16, I-18, I-20, I-22, I-24 — вышли 18 ноября. Они несли секретное оружие — сверхмалые подводные лодки с экипажем из 2 человек. Их следовало выпускать с лодки-носителя вблизи от цели. Эти подводные москиты образовали Специальный Ударный Отряд. Из первых 27 лодок I-26 пошла к Алеутским островам, а I-10 — к Самоа и Фиджи. Остальные направились на Кваджеллейн, Маршалловы острова. Там они заправились 18–20 ноября и двинулись на боевые позиции. Они должны были развернуться вокруг Оаху, чтобы провести дополнительную разведку и топить любые корабли, которые будут спасаться от атаки авианосных самолетов. Кроме того они должны были нарушить судоходство между материком и Гавайями. 5 сверхмалых лодок были спущены в 1.00 7 декабря. После атаки лодки носители должны были принять их обратно на борт возле Ланаи.