Почти до середины лета воюющие стороны занимались собственными проблемами. Русская сторона укрепляла занимаемую передовую позицию и занималась дооборудованием крепостных сооружений. Японская сторона старалась ускорить темпы наращивания через порт Дальний сил осадной 3-й армии на Квантуне и тоже укрепляла свои позиции на полуострове, ожидая контрнаступления противника. Японцы наступали к Порт-Артуру медленно и осторожно, в ожидании сосредоточения главных сил 3-й армии, предназначенной для осады Порт-Артура и ожидая контрудара противника из крепости. Почти ежедневно происходили перестрелки между отрядами боевого охранения, но до серьезного боя они не доходили. Русская сторона действовала только группами “охотников”, ведя таким образом разведку. Только 9 июня японцы сделали разведку боем силой пехотного батальона. Они попытались атаковать позицию русских на горе Уайцейлаза, но были отбиты. Когда через два дня японцы повторили попытку, русские снова отбили атаку и даже заняли деревню Бейхогоу.

Гора Куинсан, находившаяся в руках русских, мешала планам японцев перенести промежуточную базу Объединенного флота в Дальний. Она возвышалась над окружающей местностью, что давало возможность обстрела порта. Кроме того, с горы отлично просматривались тылы 3-й армии. В распоряжении Ноги уже находились 1-я и 11-я пехотные дивизии вместе с отрядами артиллерии, кавалерии и саперов (всего 30 000 человек), которые занимали 18-20-километровый участок фронта поперек Квантунского полуострова, от бухты Инчензы до бухты Сикау. В штабе 3-й армии было решено захватить Куинсан вместе с близлежащим районом силами 11-й пехотной дивизии. Вопреки предположениям японцев, русские не укрепили гору, на ней находилась только стрелковая рота с двумя горными орудиями калибра 63,5 мм, а всю переднюю позицию (от бухты Инчензы до Сикау) занимали отряды 4-й и 7-й стрелковых дивизий (девять батальонов), усиленные отрядами добровольцев, 38 орудиями и 8 станковыми пулеметами. Их резерв (шесть батальонов, 32 орудия) базировался на Волчьих горах. Всеми силами командовал генерал Фок.

Утром 13 июня после артиллерийской подготовки 11-я японская пехотная дивизия ударила по правому флангу русских, который защищали три батальона и пять отрядов добровольцев, отбросила их и прорвалась на склоны горы Куинсан. Наступление сухопутных войск из бухты Сяобиньдао поддерживали две вспомогательные канонерки, четыре истребителя (2-й отряд) и одиннадцать миноносцев (6-й, 10-й и 21-й отряды). В помощь державшим оборону войскам Витгефт выслал в бухту Сикау отряд кораблей контр-адмирала Лощинского (“Новик”, канонерки “Отважный”, “Гремящий”, “Бобр” и сводный отряд из четырнадцати миноносцев), который вынудил японские корабли отойти и начал обстреливать позиции 11-й дивизии противника. В 16.00, когда были израсходованы все приготовленные для обстрела берега боеприпасы на горизонте показались корабли 6-го боевого отряда контр-адмирала Того, а также 4-й отряд эскадренных миноносцев и 16-й отряд миноносцев русский отряд начал отходить к Порт-Артуру. При этом произошла перестрелка, в которой Лощинского поддержали вышедшие на рейд крейсеры “Аврора” и “Диана”.

Тем временем 43-й пехотный полк 11-й японской дивизии выбил защитников с горы Куинсан и занял ее. Получив об этом известие, Фок вывел свои силы за реку Лунванхэ, оставив Зеленые горы. Потрясенный этим Кондратенко, чьи отношения с Фоком и так были напряженными после боя под Цзиньчжоу, упросил Витгефта вновь послать корабли для поддержки своих отрядов, так как считал, что Ноги будет продолжать наступление. 14 июня вслед за тральщиками в бухту Лунвантан (при входе было уничтожено 7 мин) вновь вошел отряд Лощинского (канонерку “Бобр” заменил “Гиляк”) и до 20 часов вечера вновь обстреливал японские позиции. Возвращавшийся в порт отряд попытались атаковать японцы силами 12-го отряда миноносцев. Русские корабли открыли огонь и сорвали вражескую атаку, повредив миноносец “50” (в корму попал снаряд, 1 раненый), “51” (в миноносец попал снаряд, 2 раненых) и “52” (близкий разрыв, 1 раненый). По пути к базе 14 июня поврежденный “51” напоролся в утреннем тумане на подводную скалу возле острова Южный Саньпандао, переломился и затонул (1 убитый, 13 пропавших без вести, в том числе и командир капитан-лейтенант Кэндо).

Так как Ноги прервал наступление, ограничившись захватом горы Куинсан, Кондратенко сумел убедить Стеселя провести контрнаступательную операцию и выбить противника с занятых позиций. Поскольку подготовка затянулась, наступление решено было начать только 3 июля. В течение двух дней успешно действовавший 26-й стрелковый полк (им лично командовал Кондратенко) отбил Большой перевал и гору Семафорная, тесня японцев с Зеленых гор. Его поддерживал отряд контр-адмирала Лощинского (“Новик”, три канонерки, “Гайдамак” и 2-й и 3-й отряды миноносцев), который 19-го и 20 июня вслед за тральщиками (уничтожено 11 мин) дважды заходил в бухту Лунвантан. Несмотря на помощь эскадры, наступление русских отрядов на Куинсан закончилось неудачей. Начал наступление в ночь с 19-го на 20 июня сводный отряд полковника Савицкого из 4-й стрелковой дивизии. Гору, на вершине которой японцы построили редут, обороняли семь пехотных батальонов. Хотя Савицкий и дошел почти до вершины (оставалось 400-1000 шагов), а Фок на этот раз обеспечил ему артиллерийскую поддержку (30 орудий), выбить оборонявшихся не удалось. После многочасового боя из-за начавшегося ливня атака была прервана. Воспользовавшись тем, что силы японцев были связаны обороной вершины, Кондратенко решил развить успех своего 26-го стрелкового полка и пробиться в тылы 3-й армии, а если ситуация и дальше будет ему благоприятствовать, ударить по Дальнему. Уже не доверяя Фоку, он хотел заменить его полки своими и при поддержке артиллерии обеих дивизий, нанеся одновременно удар по Дальнему с моря (броненосец, четыре крейсера), начать наступление. Фок категорически отказался с ним взаимодействовать, а перепуганный Стессель, опасаясь японского контрнаступления, запретил Кондратенко осуществлять “какое-либо наступление на Дальний”. В свою очередь Витгефт ограничился лишь очередной отправкой в бухту Лунвантан отряда Лощинского (на этот раз в его состав вошли “Аврора”, четыре канонерки и восемь миноносцев). Более того, известие о готовящемся наступлении на Дальний дошло до противника. Ночью с 20-го на 21 июня японцы неожиданно ударили по левому флангу готовившегося к атаке 26-го стрелкового полка, парализовав его наступление и вынудив отойти на исходные позиции. Отряд Лощинского был атакован 5-м боевым отрядом под флагом вице-адмирала Катаоки и отошел после перестрелки (на канонерке “Бобр” было повреждено орудие калибра 9”). В результате боев 19-21 июня русские потеряли гору Куинсан, хотя и сохранили позиции на Зеленых горах, при этом погибли или попали в плен 636 человек. Потери японцев оцениваются в 300-450 человек убитыми.

Спустя двое суток, 22 июня, подорвавшись на русской мине, затонула в районе острова Южный Санынандао канонерская лодка “Каймон”, возвращавшаяся после ночного минирования бухты Лунвантан (22 убитых, в том числе командир, капитан второго ранга Такахаси).

25 июня “Аскольд” стоявший на внешнем рейде, на якоре обстрелял японские истребители занимашиеся разведкой на внешнем рейде.

На следующий день в бухту Тахо перешли в сопровождении канонерских лодок, миноносцев и тральных судов “Полтава”, “Аврора”, “Паллада” и “Новик” и приступили к обстрелу японских позиций. В 12 ч. 20 мин. на дистанцию 3 мили сблизились “Ицукусима”, “Хасидате”, “Акаси”, “Акицусима”, 1-й отряд истребителей и 16-й отряд миноносцев и обстреляли русских, которые в свою очередь открыли ответный огонь сразу добившись накрытий. От близких разрывов пострадал “Акаси”. Ввиду этого японцы немедленно увеличили дистанцию до 5 миль. К 16 часам русские корабли вернулись на внутренний рейд.

В полночь с 26 на 27 июня береговые батареи обстреляли и повредили снарядом японский параход-заградитель. Несколько часов спустя японские миноносцы безрезультатно атаковали крейсер “Аврора” охранявший проход.