Со всеми этими трудностями можно легко справиться с помощью любого химического редактора. Таких редакторов существует огромное количество. В этом разделе рассмотрим редактор химических структур ChemPen3D по двум причинам. Во-первых, ChemPen3D крайне прост в использовании и научиться создавать в нем сложные формулы можно практически интуитивно. Во-вторых, по сравнению с другими аналогичными редакторами, он очень компактен и занимает всего лишь 2,5 Мбайт пространства на жестком диске. Так что смело устанавливайте ChemPen3D на свой компьютер и учитесь оформлять рефераты и другие письменные работы по химии красиво.
Рассмотрим работу с trial-версией программы ChemPen3D. Запустив ее, проигнорируйте запрос регистрационного кода и нажмите кнопку ОК.
Чтобы не ограничиваться сухим описанием пунктов меню (рис. 3.13), будем обращаться к ним по ходу создания органической реакции.
Рис. 3.13. Главное меню программы ChemPen3D
В качестве примера выберем схему получения фенола из кумола (изопропилбензола) путем окисления кислородом воздуха. Именно таким способом фенол получают в промышленности.
Начнем с бензольного кольца. Чтобы вставить его в документ, выполните команду Benzene → Add (Бензол → Добавить), затем поместите указатель (в ChemPen3D он имеет вид плюсика) в область, где будет размещаться формула, и щелкните кнопкой мыши.
Внимание!
Запомните: любая структура вставляется в документ щелчком левой кнопкой мыши после выполнения соответствующей команды.
Примечание
С каждым новым щелчком в рабочей области будет появляться структура, которая была выбрана последней командой. Чтобы избежать этого, нажмите Reset либо сразу же переходите к выполнению новой команды. Отменить последнее действие можно, нажав Undo.
Теперь в кольцо нужно ввести изопропильный радикал. Для этого выполните команду Chain → Branch → i-Propyl (Цепь → Ответвление → Изопропил) и щелкните возле того атома, к которому должен присоединиться заместитель. По умолчанию в С-С-связях атомы углерода скрыты, поэтому углеродные цепи отображаются в виде веточек или зигзагов. Такая форма записи для многих непривычна и малопонятна. Чтобы вернуться к знакомому виду, в месторасположении каждого атома углерода в цепи щелчком правой кнопкой мыши откройте панель Atom Tool (Атом) и нажмите кнопку АНп. В результате в углеродной цепи появятся атомы углерода с количеством атомов водорода, определенным правилами валентности.
Если расположение объекта в документе вас не устраивает, можно перемещать его по рабочей области. Выделите весь объект голубой рамкой, передвигая мышь при нажатой левой кнопке. В результате он окрасится в красный цвет. Таким же образом поместите структуру в новое место и нажмите Done (Выполнено) в окне Editor Group (Редактор групп) (параметры данного окна в данном случае малозначимы, поэтому рассматривать их не будем). Для удаления объекта нажмите Delete (Удалить) в этом же окне.
Так же, без разрыва связей, можно перемещать и части молекулы. Для этого голубой рамкой нужно выделить не всю структуру, а отдельную группу, а затем переместить ее в нужном направлении.
Чтобы ввести стрелку, нажмите кнопку Symbol. В открывшемся окне Add Symbol (Добавить символ) щелкните на >, а затем на участке, куда нужно добавить стрелку.
С созданием молекулы кислорода 02 придется немного потрудиться. Дело в том, что в текстовом режиме не предусмотрены верхние и нижние индексы, поэтому набрать формулу как текст не получится. Будем «собирать» молекулу «по частям».
Атом кислорода выберите в окне Periodic Table (Периодическая таблица), открывающемся командой Atom → Add (Атом → Добавить). Индекс добавьте как текст. Откройте окно Add Symbol (Добавить символ) командой Symbol (Символ) и нажмите кнопку Text (Текст). После щелчка на рабочей области там, где должна появиться цифра, откроется окно текстового редактора (Text Editor) (рис. 3.14). Наберите в строке ввода 2 и нажмите кнопку Done (Выполнено). Таким образом в ChemPen3D можно создать любые текстовые комментарии. Чтобы удалить текст, щелкните на нем правой кнопкой мыши и в окне Text Editor (Редактор текста) нажмите кнопку Delete (Удалить).
Кстати, если вас устроит структурная формула кислорода (0=0), вы можете поместить ее в документ, выполнив команду Atom → Add Molecule → 02 (Атом → Добавить молекулу → 02).
Рис. 3.14. Создание текста в ChemPen3D
Первая половина реакции готова. Перейдем к фенолу. Как создать бензольное кольцо, вам уже известно. ОН-группа добавляется командой Branch → ОН (Присоединить → ОН) и щелчком возле атома, к которому она должна присоединиться.
Знак «+» вводится со знакомой панели Add Symbol (Добавить символ), вызываемой командой Symbol (Символ). Удалить его можно так же, как и текстовый комментарий.
Осталось лишь нарисовать молекулу ацетона. Вспомним название ацетона по номенклатуре – пропан-2-он. Значит, чтобы получить ацетон, к молекуле пропана в положение 2 нужно ввести кетогруппу =0. Так и поступим. Пропан поместим в документ, выполнив команду Chain → Add → З-Propane (Цепь → Добавить → З-Пропан) (цифра возле названия углеводорода показывает количество атомов в углеродной цепи). Кетогруппу введем командой Branch → =0 (Присоединить → =0) и щелчком возле положения 2 в пропане. Как визуализировать углеродные атомы, читайте выше, в описании создания молекулы изопропилбензола.
Итак, уравнение реакции готово. Чтобы в реферате оно смотрелось гармонично, нужно привести в соответствие шрифты, применяемые при оформлении работы, и начертание символов в ChemPen3D. Так, если при наборе текста вы используете стандартный для документов Word шрифт Times New Roman с кеглем 10–12 пт, то такие же настройки лучше применить и в ChemPen3D. Для этого выполните команду File→ Font (Файл → Шрифт) и установите в открывшемся окне необходимый шрифт и кегль.
Вставить уравнение реакции в документ Word можно следующим образом. Выполните команду File → CopyToClipboard (Файл → Копировать в буфер), откройте документ Word и вставьте реакцию стандартным способом – командой Вставить контекстного меню.
Сделаю еще несколько замечаний, которые в дальнейшем помогут вам при создании формул.
Чтобы заменить в молекуле один атом на другой, щелкните на нем правой кнопкой мыши и выберите в окне Atom Editor (Атомный редактор) новый. Кнопки R.AHn и R.nHA на открываемой параллельно панели Atom Tool (Атом) служат для смены последовательности атомов в группе. Так, с их помощью ОН-группу можно записать в форме НО.
Если требуется заменить одинарную связь на двойную или тройную, точно так же щелкните на ней правой кнопкой мыши и проведите нужные замены. Всегда следите за соблюдением валентностей – программа не сообщает о нарушении их правил.
Чтобы создать копию структуры, выделите ее мышью и в открывшемся окне Group Editor (Редактор групп) нажмите Clone (Дублировать).
В ходе написания реакции мы обратились практически ко всем меню ChemPen3D. Чтобы у вас не возникло путаницы с их многочисленными командами, коротко скажем о назначении наиболее важных из них.
• Symbol (Символ). Вызывает окно Add Symbol (Добавить символ), из которого в рабочую область можно вставить стрелки-разделители реагентов и продуктов реакции (в том числе и обратимой), символы частичных зарядов на атомах, знаки «+», «°С». Отсюда же кнопкой Text (Текст) вызывается окно текстового редактора (Text Editor), в котором создаются комментарии.
• Benzene (Бензол). Команда Add (Добавить) помещает в документ молекулу бензола, Branch (Присоединить) вводит в структуру фенильный радикал, Fuse (Слить) позволяет создать конденсированное ароматическое соединение путем присоединения по двойной связи к бензольному кольцу (если оно есть в документе) еще одного кольца.