3 октября I./JG 400 насчитывала 17 самолетов, а в 3-й и 4-й эскадрильи было 13 машин. Обе эскадрильи получили приказ передислоцироваться в Штаргард на аэродром Клютцар, куда и прибыли еще до конца первой недели месяца. 6 октября погиб во время налета на аэродром механик 4./JG 400 Герхард Шарфф.
7 октября 1944 года выдался жарким. В 12:00 с аэродрома Брандис по тревоге поднялись «Кометы» Шуберта, Ботта, Глогнера, Гуссера и Айзенманна. Их целью были американские бомбардировщики из 95 BG. Ботт заявил один сбитый В-17. Унтер-офицер Манфред Айзенманн при посадке таранил на своем самолете (BQ+VO, W.Nr. 440013) три стоящие «Кометы» и погиб. В тот же день погиб ас JG 400 фельдфебель Зигфрид Шуберт, вылетевший на Me 162V61 (GN+MD, W.Nr. 10070). Причиной гибели пилота стал взрыв топлива на старте. Оставшиеся пилоты: Ренкауфт, Циммерманн, Гуссер, Мюлыптро и Андерс — имели больший успех. В 12:31 их «Кометы» начали атаку. Правда трем «Мустангам» из 364 FG (Э.А. Тейлор, У.Э. Эрфкемп, Э.Н. Фаррелл) удалось сбить Me 163 (W.Nr. 440165) обер-фельдфебеля Фридриха Петера Гуссера. Сам Гуссер был ранен в голову, а его самолет получил серьезные повреждения. Но остальные «Кометы» беспрепятственно провели атаку и сбили два В-17. В октябре начались учебные полеты на Me 163 с аэродрома Удетфельд. В III./JG 400 прибыли пилоты, которые уже прошли курс полетов на планерах в летной школе Гельнхаузен. Первые полеты проводились на Me 163A. а затем им дали по три раза взлететь на Me 163В. Командир 13./JG 400 Нимайер пользуясь своими дружескими связями и избытком свободного времени вооружил один из своих Me 163A ракетами R4M. До конца октября 1944 года самолеты JG 400 лишь изредка поднимались в воздух. 9 октября Me 163 попытался перехватить курьерского «Москита» из 544-й эскадрильи RAF, который в рамках программы «Fruge!» доставляли авиапочту в Советский Союз. Попытка закончилась неудачей. Аналогично закончилась и попытка перехватить одиночный Р-51 26 октября 1944 года в 14:35.
Me 163В-1 в Museum of Flight, Ист-Форчун.
Me 163В, W.Nr. 191095.
2 ноября американцы провели массированный налет на завод синтетического топлива в Лейне. В налете участвовало 687 В-17, 400 Р-51 и 30 Р-38. На перехват противника вылетели Ролли, Штарцники, Болленрат, Андреас и Глогнер. Андреас атаковал В-17, но и сам оказался сбит капитаном Ф.У. Глорером из 4 FG. «Комета» Андреаса взорвалась в воздухе, но за несколько секунд до взрыва пилот сумел покинуть самолет, благополучно приземлился и автостопом вернулся в расположение своей части. Самолет обер-фельдфебеля Якоба Болленрата (W.Nr. 440003, BQ+VF) был сбит капитаном Л.Х. Норли из 335 FS. Третьим неудачником дня стал обер-фельдфебель Хорст Ролли из 2./JG 400, который погиб в кабине своей «Кометы» (W.Nr. 440007, BQ+VJ).
18 ноября во время налета союзников на аэродром Лехфельд на земле был уничтожен один Me 163. Другая «Комета» получила повреждения. 18 ноября во время учебного полета был поврежден Me 163 (W.Nr. 440172) обер-фельдфебеля Августа Мюллера. Сам Мюллер с травмами попал в госпиталь в Паунсдорфе. В начале декабря I./JG 400 возглавил бывший командир 1-й эскадрильи, капитан Фульда. Прежний командир группы капитан Опиц стал командовать II./JG 400, сформированной 12 декабря 1944 года из 3-й и 4-й эскадрильи, которые по такому случаю сменили номера на 5 и 6. Таким образом JG 400 стал состоять из трех групп. Командиром полка назначили Вольфганга Шпете, который в ноябре вернулся из JG 54. Конец года «Кометы» больше стояли на земле. 12 января 1945 года Восточный фронт приблизился к базе III,/JG 400 и группу передислоцировали в Брандис.
16 января капитан Г.Г. Каллаус из 353 FG стал очевидцем того, как Me 163 взорвался, упав на аэродроме Лехфельд.
Вскоре под угрозой оказалась и база в Штаргарде. Опиц приказал передислоцироваться в Бад-Цвишенан, Нордгольц и Гузум.
Me 163, W.Nr. 191907 (AM 222) в экспозиции Australian War Museum, Канберра.
Me 163, W.Nr. 191904 на выставке в Абингдене, 1970 г.
Me 163 W.Nr. 191904 в Колене.
Чем ближе к концу войны, тем меньше была активность JG 400. 10 февраля 1945 года погиб фельдфебель Герхард Мер (DS+VV, белая «2»). На следующий день получил ранение унтер-офицер Освин Шюллер (W.Nr. 191111, SC+VJ). 23 февраля самолеты 355 FG атаковали аэродром Лехфельд, уничтожив на земле четыре Me 162. 2 марта 1945 года в воздух поднялось 6 Me 163, но летчикам не удалось обнаружить противника. На следующий день немецкие пилоты заявили три сбитых В-17. 7 марта 1945 года две «Кометы» атаковали в районе Розиц разведывательный «Спитфайр» PR.XI (PL886) из 542-й эскадрильи RAF. Английскому пилоту флайт-лейтенанту Рейби удалось уйти, набрав скорость в ходе крутого пике с 12000 до 6000 метров.
15 марта Me 163 снова вылетели на перехват американских бомбардировщиков. Целью налета 1340 В-17 и В-24 был Лейпциг. Одну сбитую «Комету» заявил капитан Р.С. Уитмор из 359 FG. Немецкий пилот выпрыгнул с парашютом, а самолет разбился.
16 марта 1945 года обер-лейтенант Рольф Глогнер перехватил над Лейпцигом «Москито» PR.XVI (NS795) из 544-й эскадрильи RAF и повредил его. «Москито» сумел дотянуть до аэродрома Лилль во Франции, но разбился при посадке. Пилот «Москито», летный офицер P.M. Хейс был награжден крестом DFC.
17 марта 1945 года Фриц Кельб после боя насчитал в своем Me 163 146 пробоин. 19 марта группу из 978 американских бомбардировщиков атаковало 40 немецких истребителей, в том числе Me 163 и Me 262. Пилоты Me 262 заявили три сбитых В-17, пилоты Me 163 победами похвастаться не смогли.
24 марта 1945 года пилоты 483 BG заявили один вероятно сбитый Me 163. 30 марта 1945 года одиночная «Комета» из II./JG 400 пыталась атаковать американские бомбардировщики, но истребители сопровождения из 355 FS не подпустили немца. На следующий день пилоты 479 и 353 FG докладывали о встрече в воздухе с Me 163.
Одна из английских «Комет», старательно восстановленная после войны.
9 апреля 1945 года на перехват пары Р-38 из-под Брандиса вылетели две «Кометы» (Ботт, Рёзле). Немецкие пилоты набрали слишком большую скорость и не смогли обнаружить противника.
10 апреля 1945 года лейтенант Фриц Кельб с помощью гранатомета SG 500 Jaegerfaust сбил самолет противника. (В последний день войны Кельб погибнет на Me 262). В тот же день победу одержал Глогнер, который сбил «Москито», шедший на высоте 14000 м. Экипаж сбитого самолета покинул машину с парашютом. «Комета» Глогнера сильно обледенела и пилот едва сумел дотянуть до аэродрома. В начале апреля дефицит топлива стал еще сильнее. Часть личного состава I,/JG 400 мобилизовали и отправили в качестве пехотинцев на фронт в Чехословакию. В качестве вооружения использовали снятые с самолетов пушки МК 108, установленные на шасси грузовых машин. Тем временем, Р. Опиц, командир II./JG 400, дислоцированной в районе Гузума, все силы прикладывал к тому, чтобы машины группы не простаивали на земле. Главной проблемой, как и всюду, была нехватка топлива. Каким-то чудом удалось раздобыть немного топлива, как раз хватило на заправку трех «Комет». 22 апреля 1945 года Опиц отправился на базу истребителей в районе Гузума, чтобы скоординировать свои действия. В это время над Гузумом появился 641 «Ланкастер», из которых один был сбит поднятым по тревоге ключом П./ JG 400. Эту победу подтверждает и командир крыла Р.Б. Бьюмонт, который находился в расположенном рядом лагере военнопленных и был свидетелем боя. С другой стороны, в документах II./JG 400 нет ни каких упоминаний о пилоте, одержавшем единственную в истории группы победу. К концу войны Опиц располагал 80 «Кометами» и 60 пилотами. Война для II./ JG 400 закончилась 8 мая, когда попавший в госпиталь Опиц (травма из-за неудачного старта) сдал свою группу в плен англичанам. Союзнические истребители сбили в воздухе 6 Me 163, а бортстрелки бомбардировщиков около 10. Гораздо больше «Комет» было потеряно из-за аварий. В I./JG 400 в период между 22 мая 1944 года и 20 января 1945 года было потеряно 17 «Комет».