Магистр постарался восстановить институт братьев-священников. При его правлении пятьдесят четыре священника были прияты в орден. Дабы обеспечить их образование, он организовал семинар в Ланненге, затем в замке Эзенберг (Моравия), на который выделил сумму в триста семьдесят тысяч флоринов из своих личных средств.

Правление Максимилиана-Иосифа позволило Тевтонскому ордену частично вернуть себе былую славу. Щедрость магистра обеспечила возможность строить и содержать многочисленные больницы, богадельни и монастыри, что возвращало деятельность ордена к своему первоначальному предназначению. Его преемник, эрцгерцог Вильгельм, продолжал ту же политику. После блестящей военной карьеры, которую он завершил в должности фельдмаршала, благодаря чему он непосредственно столкнулся с человеческими страданиями в крупных сражениях, в которых принимал участие — Сольферино, Мадженто, Садова, — эрцгерцог Вильгельм, соответственно, всеми силами способствовал расширению госпиталей под эгидой ордена. Он в 1880 г. организовал «Добровольную санитарную службу в мирное время и в военное время», в которой работали добровольцы, приписанные к ордену Св. Марии. Выходцы из австро-венгерского дворянства, они обязывались оказывать финансовую помощь и лично принимать участие в уходе за ранеными и пострадавшими от войны. Орден смог оснастить вначале лишь два полевых госпиталя и тридцать восемь полевых лазаретов, но в 1872 г. располагал уже тысячью шестьюстами добровольцами. В каждом конфликте, в котором так или иначе участвовала империя, члены ордена выполняли свою миссию по уходу за ранеными и обездоленными; в 1877-1878 гг. в Боснии-Герцоговине он оказывал помощь жертвам турецкой резни, в 1885 г. вовсю развернулся во время болгарско-сербского конфликта, в 1912-1913 гг. во время балканских войн.

Во время Первой мировой войны при великом магистре эрцгерцоге Евгении (1894-1923) орден доказал свою эффективность в помощи больным и раненым с обеих сторон; он присутствовал на всех фронтах от Карпат и Галиции до Сербии, орден развернул четыре полевых госпиталя, отправил пятнадцать колонн грузовиков с медикаментами и машин «скорой помощи», члены ордена в больницах и диспансерах, расположенных в тылу, обеспечили уход за двумя-тремя тысячами солдат. Орден таким образом исполнял ту миссию, которую осуществляли первые тевтонские рыцари в Святой земле во время осады Акры в 1190-1191 гг.

Крах австро-венгерской империи и ее распад в октябре 1918 г., казалось, предвещал в очередной раз конец Тевтонского ордена, имеющего тесные связи на протяжении трех веков с Габсбугским домом. В большинстве государств, появившихся после распада монархии, в Чехословакии, Югославии, Италии, которая только что аннексировала южный Тироль, на Тевтонский орден стали смотреть как на символ Габсбургов. Правители государств-преемников, а также преемники Антанты не скрывали своих антибуржуазных и антикатолических чувств и охотно пожертвовали орденом, признанным анахроническим и антидемократическим институтом. Конференция представителей государств Антанты открыто заявила о своей враждебности к Габсбургам в декларации от 2 февраля 1920 г., объявила, что выступает против восстановления дома Габсбургов в Венгрии. Это не было пустым заявлением, так как дважды, в марте и октябре 1921 г., Антанта угрожала Венгрии военным вмешательством, если император Карл возвратится на трон. При поддержке со стороны сильных держав преемники империи предложили конфисковать владения Тевтонского ордена, расположенные на их территориях, так как здесь речь шла об императорских вотчинах.

Дабы спасти Тевтонский орден, магистр эрцгерцог Евгений, считавший, что его положение как главы ордена может способствовать мнению, будто орден является владением Габсбургов, попросил у папы Пия XI в 1923 г. разрешения уйти в отставку. Папа, озабоченный тем, чтобы поддерживать хорошие отношения с государствами-преемниками, его отставку принял. Архиепископ, высланный в Базель с тех пор, как все Габсбурги были изгнаны из Австрии республиканским правительством, созвал генеральный капитул в Вене, дабы назначить коадъютора. По его просьбе избиратели остановили свой выбор на брате-священнике ордена Норберте Клейне, бывшем епископе Брунна (Брно), который был изгнан из своей епархии чехословацкими властями. Основной задачей коадъютора явилось стремление «приспособить» Тевтонский орден к новым геополитическим условиям, принимая в расчет настроения государств-преемников, на территории которых находились владения ордена. Дипломаты государств-преемников и представители Австрийской Республики приняли участие в обсуждении реальных связей между орденом и Габсбургами. В конечном счете точка зрения австрийских дипломатов, согласно которой Тевтонский орден был, в сущности, орденом религиозным, победила. Но Тевтонскому ордену пришлось столкнуться с нападками представителей Церкви. Папа Пий XI поручил своему прелату рассмотреть жалобы, выдвинутые против Тевтонского ордена. Некоторые утверждали, что Тевтонский орден должен подчиняться ордену госпитальеров, ставшему Мальтийским, что владения Тевтонского ордена должны быть переданы Мальтийскому ордену. Прелат встал на защиту Тевтонского ордена, но попросил орден считаться с новой ситуацией. Принятое генеральным капитулом новое правило было утверждено папой 27 ноября 1929 г.

Устав, принятый в 1929 г., коренным образом изменил характер деятельности ордена. Название «Орден тевтонских рыцарей» (Deutsche Ritterorden) должно было измениться; отныне члены ордена должны носить имя «Братья немецкого ордена Святой Марии Иерусалимской», но руководитель ордена носил титул магистра. Орден становился религиозным орденом со статусом, аналогичным статусу других религиозных орденов, независимых от епископов и светских властей в странах, относящихся к конкордату Единственная сохраненная привилегия ордена — рыцарская инвеститура. Магистр, избранный капитулом ордена, носил сан аббата. Папский престол сохранял право контроля за деятельностью ордена. На этот раз не император Австрии, а папа во имя государственных интересов навязывал решения Тевтонскому ордену, людям, которые не совершили недостойных поступков, хотя, угождая сильным мира сего, он отстранил от должностей многочисленных прелатов и руководителей религиозных конгрегации в государствах-преемниках под предлогом того, что они были назначены на эти должности во время империи. У Тевтонского ордена таким образом отобрали всю его былую славу.

На долю Тевтонского ордена выпало еще немало испытаний. Вскоре после «Аншлюса» и аннексии Австрии в пользу «Великой Германии» в марте 1938 г. орден подвергся жестоким репрессиям со стороны нацистских властей, которые видели в нем бастион легитимного «проГабсбургства». Магистру Роберту Шэльцки (1936-1948) пришлось встретиться лицом к лицу с новым режимом. Декретом от 6 сентября 1938 г. орден был распущен и его имущество конфисковано. Многие братья были арестованы и высланы, в том числе и магистр. После создания немецкого протектората в Богемии-Моравии в марте 1939 г. учреждения ордена, оказавшиеся на этой территории, ждала та же участь. Что касается членов ордена в Югославии и Тироле, их положение оставалось всегда шатким, их госпитали были реквизированы и переданы армиям стран Оси.

Превратности судьбы. В тот момент, когда национал-социалистическая Германия уничтожила Тевтонский орден, некоторые высокопоставленные нацистские бонзы, такие как Генрих Гиммлер, попытались использовать в своей идеологии символику тевтонских рыцарей, например, в официальных документах они часто ссылались на политику Тевтонского ордена на Востоке, оправдывая этим план «Барбаросса» и порабощение славянских народов. Гиммлер при организации СС использовал некоторые элементы, заимствованные у средневековых военных орденов, и видел, не сомневаемся в этом, в своем Черном ордене воплощение Ордена тевтонских рыцарей, но не обремененного идеалами христианства. Крепость Вевельсбург, которую Гиммлер хотел превратить штаб-квартиру СС, была построена по образу и подобию крепостей ордена в Пруссии. Но здесь и заканчиваются аналогии, так как тевтонские рыцари, верные Риму и Богу, преследовались нацистским режимом так же, как преследовались прусские аристократы, предки которых в XVI столетии, как правило, тевтонские рыцари, не перешли на сторону Реформы. Сегодня они оказались жертвами социальной революции, проведенной Адольфом Гитлером.