С момента триумфа Массены во второй битве при Цюрихе военная инициатива перешла в руки французов. Еще задолго до окончательного крушения мирных переговоров Бонапарт разрабатывал альтернативные планы, ставившие целью военное поражение Австрии и возврат всех французских завоеваний в Италии, утраченных в 1799 году. Он намеревался при необходимости добиться быстрой, решающей победы посредством стратегического наступления; он был твердо настроен избегать повторения длинного ряда операций, подобных тем, что он предпринял в Италии четырьмя годами ранее. Сейчас же, в 1800 году, германский и итальянский фронты должны будут иметь более тесную координацию, чем прежде, и будет максимально использована бесценная стратегия центрального положения, которое создавала Швейцария. Победа должна быть завоевана в результате масштабных концентрических наступательных действий, рассчитанных на нанесение удара по тылу, вынуждающего противника либо принять сражение, либо капитулировать.

Первый план кампании 1800 года был сформулирован еще в декабре 1799 года. В нем Бонапарт намечал, что Германия станет главным театром войны. Это было логичным решением, так как в Германии дислоцировалась самая большая неприятельская армия и через эту страну пролегал кратчайший путь к Вене, после того как будут устранены препятствия на Дунае и в Шварцвальде. «Обладание Швейцарией давало нам возможность зайти в тыл операционных направлений противника в Италии и в Швабии. Моей первой мыслью было оставить армию Массены в обороне на Апеннинском полуострове, а Резервную и Рейнскую армии направить в долину Дуная. Конституция VIII года не позволяла консулу лично командовать армией; поэтому моим намерением было передать командование Резервной армией заместителю и оставить главную армию под командованием Моро; но, следуя за штабом последнего, я мог бы координировать действия обоих. Я желал, чтобы Моро переправился у Шафхаузена, нанес удар по генералу Краю с тыла и оттеснил его в угол между Рейном и Майном, отрезав от Вены; другими словами, чтобы он выполнил против левого фланга австрийского генерала ту же операцию, которую пять лет спустя я провел против правого фланга Мака у Донауверта; после этого мы могли бы беспрепятственно двигаться по Австрии, чтобы в Вене возвратить себе Италию…», — вспоминал Наполеон.

Некоторые военные историки оспаривают подлинность последующих объяснений бароном Жомини первоначальных намерений Наполеона. Они утверждают, что с самого начала Италия была предназначена для Резервной армии. Одна выдержка из Correspondence de Napoleon I-ier (Paris: 1858), Vol. XXX, p. 399, особенно подтверждает этот взгляд. Резервной армии предстояло «двинуться на помощь Рейнской армии, если возникнет такая необходимость, затем позднее выйти через Швейцарию на рубеж р. По, чтобы нанести удар в тыл австрийской армии». При первом прочтении действительно может показаться, что приоритет отдается итальянскому фронту, но более вероятным можно считать, что такая формулировка данной фразы рассчитана на тактический намек, а именно, Резервная армия не должна без приказа вмешиваться в проводимые Моро главные операции, за исключением случаев форсмажорных обстоятельств.

Генерал Моро получил массу инструкций, детально регулирующих выполнение этого плана. Бонапарт думал о славе, а Моро — о людях и о спасении республики. В своих посланиях к Моро Бонапарт обращается к генералу если не как к заурядному капралу, то как к командиру роты капралов. Вот выдержки из некоторых приказов, адресованных генералу Моро первым консулом: «Военный министр сообщил мне, что вы, гражданин генерал, направили ему доклад о состоянии армии на 20 нивоза. Я не могу принять ни одно из ваших предложений, так как они давно устарели. Прошу вас направить мне точную численность личного состава, а также проект новой организации армии, о которой вы говорили министру…» Далее в Инструкции по составу дивизий Рейнской армии от 26 плювоза VIII года Бонапарт пишет: «Я желаю, чтобы вы сформировали дивизии по следующему принципу: в наиболее сильных дивизиях вам надлежит иметь четыре полубригады и одну легкую; в слабых — только четыре. Каждая дивизия должна иметь не более двух бригадных генералов и одного генерал-адъютанта. Наиболее сильные — на одного бригадного генерала или генерал-адъютанта больше. Вам надлежит также придать каждой дивизии максимально возможное количество кавалерии, минимум один полк гусаров и конных егерей. Вся ваша кавалерия также должна быть разделена на дивизии, в каждой из которых по 5—6 полков и т.д.». Разве это терминология главы правительства? Сколько же терпения должен был иметь Моро, чтобы игнорировать эти придирки и несправедливости! Видя, что Моро не реагирует, Бонапарт 10 вентоза (1 марта 1800 г.) направляет ему новые инструкции по организации пехоты в соответствии с десятичной системой: «Генералу Бертье, военному министру. Прошу вас, гражданин министр, сообщить генералу Моро специальной эстафетой, что мое намерение состоит в том, чтобы вся его пехота была подразделена на 10 дивизий по 10 000 человек в каждой с образованием четырех армейских корпусов. Первый корпус из двух дивизий, общей численностью 20 000 чел. Второй корпус — из трех дивизий, общей численностью 30 000 чел. Третий корпус — из двух дивизий, общей численностью 20 000 чел. И четвертый корпус — из трех дивизий, общей численностью 30 000 чел. Всего 100 000 чел. Четвертый корпус будет называться резервным и должен находиться под командованием генерала Лекурба, и т. д…» (цитировано по General Philebert, «le General Lecourb d'apres ses archives, sa correspondance et d'apres documents», P., 1895).

Однако, как мы вскоре сможем убедиться, Моро имел свои планы по реструктуризации армии, которые полностью отвечали целям предстоящей кампании.

К 25 апреля 1800 г. численность армии Моро была доведена почти до 140 000 человек. Правым крылом командовал генерал Лекурб. В его корпус, фактической численностью 31 797 человек, входили дивизии Вандамма, Монришара, Лоржа, Нансути и артиллерийский парк. Центром командовал дивизионный генерал Гувьон Сен-Сир. Его корпус, численностью 26 356 строевых, имел в своем составе дивизии Бараге д'Илье, Тарро, Нея, Саюка и артиллерийский парк. В левое крыло, численностью 20 624 человека, под командованием Сен-Сюзана входили дивизии Коло, Суама, Леграна, Делаборда и артиллерийский парк. И, наконец, под собственным командованием Моро имелись дивизии Дельма, Леклерка, Ришпанса и одна кавалерийская дивизия. В сумме 29 400 человек. Кроме того, с учетом контингента крепостей и укрепленных пунктов, а также так называемого Гельветического обсервационного корпуса, численность армии Моро составляла 137 619 человек, включая 137 батальонов пехоты и 143 кавалерийских эскадрона.

Начальные операции должны были задержать растянутые силы барона фон Края ложной демонстрацией наступления на Шварцвальд силами одного корпуса. Одновременно остальная часть армии должна была обрушиться на австрийский тыл через Шаффхаузен и захватить его склады в Штокахе, Энгене, Месскирхе и Биберахе. При успехе этих начальных операций Моро должен был выделить корпус под командованием генерала Лекурба, для того чтобы удержать Швейцарию, соединить германский и итальянский фронты и в любых последующих операциях действовать совместно с Резервной армией. Тем временем Массена должен был удерживать внимание Меласа в области Генуи. По своему замыслу это, безусловно, был наполеоновский план. «Наведение четырех мостов одновременно в такой высокой точке на Рейне, как Шаффхаузен, даст возможность всей французской армии переправиться за одни сутки. После прибытия в Штоках французы обойдут левый фланг неприятеля, и их армия сможет атаковать с тыла все австрийские войска, дислоцированные на правом берегу Рейна среди дефиле Шварцвальда. В течение 6—7 дней после начала кампании армия подойдет к Ульму Уцелевшие австрийцы будут отброшены назад в Богемию» (Correspondance de Napoleon I-ier (Paris: 1858), Vol XXX, p. 399). После этого французы могли бы захватить перевалы через Тирольские и Карнийские Альпы и этим перерезать линии коммуникаций Меласа; при необходимости Резервная армия затем могла бы продвинуться в Италию, завершая полную победу на обоих фронтах, и австрийскому правительству пришлось бы признать свое поражение и принять мир, продиктованный первым консулом, — другого выхода не было.