Прошло лишь три месяца, и полк потерял еще один Су-24МР. 26 сентября при выполнении посадки потерпел аварию самолет гв. л-та Иконникова и гв. л-та Зянкина. В условиях ухудшенной видимости (заходящее солнце находилось строго в створе посадочного курса) летчик допустил высокое выравнивание с последующим грубым приземлением. Самолет дал «козла» и при повторном касании основные стойки шасси не выдержали и подломились. Скользящая на брюхе машина загорелась. После остановки экипаж покинул кабину, самолет сгорел.

Экипаж гв. п/п-к Рябуха — гв. к-н Камалетдинов 30 апреля 1986 г. перед полетом на радиационную разведку над взорвавшимся реактором Чернобыльской АЭС

1 декабря стало одной из памятных дат в истории полка. 47-й ОГРАП преобразован в 1046-й Гвардейский Центр Подготовки Летного Состава Разведывательной Авиации (ЦПЛС РА). Полк потерял свой номер, с которым было связано столько событий и достижений, но зато в Шаталово вернулись МиГи — Центр имел в составе две эскадрильи: 1-я АЭ на Су-24МР, и 2-я АЭ — на МиГ-25РБ (непонятный эксперимент по переводу полков на однотипные самолеты длился два года). В то время никто не думал о традициях, а жаль, ведь двумя годами ранее все было как раз наоборот — МиГи традиционно летали в 1-й эскадрилье, а освоение Су-24МР началось во 2-й.

Основной задачей ЦПЛС была подготовка выпускников летных училищ в качестве летчиков и штурманов фронтовой разведавиации. Ежегодно в каждой АЭ проходили теоретическую и летную подготовку по 10 выпускников летных училищ, а в 1-й АЭ — еще и 10 выпускников училища штурманов. Получив соответствующий уровень подготовки и сдав на 3-й класс, лейтенантов распределяли в строевые разведполки.

1989–1990. 1 декабря 1989 г. в состав Центра введена 3-я АЭ на Су-17МЗР, и ЦПЛС переведен на новые штаты: 1-я АЭ имела 12 Су-24МР, 2-я — 12 МиГ-25РБ и 4 МиГ-25РУ, а 3-я АЭ — 12 Су-17МЗР и 4 Су-17УМЗ. Теперь в Центре могли проходить подготовку летчики для всех разведполков, ведь разведчики Су-17 состояли на вооружении в большом количестве, хотя «тройки» уже уступали место М4Р. И через год, с 30 ноября по 4 декабря 1990 г., все 12 Су-17МЗР были переданы в 381 ОРАП, 3 МиГ-25РБ и 2 МиГ-25РУ — в 39-й ОРАП. А из 827 ОРАП в Лиманском Центр получил 10 новых Су-17М4Р.

1991–1993. С августа 1991 г. по ноябрь 1993 г. 1046 ЦПЛС РА находился в составе частей центрального подчинения.

С 1991 по 1993 г. 3-я АЭ 1046-го ЦПЛС РА использовала Су-17М4Р

Обработка результатов работы фоторазведчиков

В октябре 1991 г. было проведено ЛТУ Центра, в котором принимали участие 26 экипажей из числа слушателей-выпускников 1990 года (10 на Су-24МР, 10 на Су-17М4Р и 6 на МиГ-25РБ).

3 ноября 1992 г. 1046-му Центру была поставлена задача отправить в зону чрезвычайного положения осетино- ингушского конфликта оперативную группу в составе 4 экипажей на Су-24МР и необходимых специалистов обеспечения воздушной разведки. С 6 ноября по 2 декабря экипажи выполнили 33 б/в с оперативного аэр. Моздок. Разведка в районах н/п Владикавказ, Грозный, Беслан, Малгобек, Ьалта, Джайрах, Краснооктябрьское, Мужичи, Верхний Алхун отслеживала визуально и при помощи аэрофотосъемки обстановку в районе конфликта.

В ноябре 1992 г. начальником Центра стал гв. п-к А. Водолазский.

Наконец, 1 ноября 1993 г. 1046 Гв. ЦПЛС РА на основании директивы ГШ ВВС снова преобразован в 47-й ОГРАП. Как и Центр, полк имел 3 эскадрильи, но век Су-17 уже закончился, и в 1-й АЭ остались Су-24МР, во 2-й АЭ — МиГ-25РБ, а 3-я АЭ тоже перешла на МиГи. Полк вошел в состав 16-й ВА МВО.

1994. С февраля командиром полка стал гв. п-к А. Белевич. Начиная с марта летчики выполняли специальные и боевые задания в районах региональных конфликтов на территории России и стран СНГ. С 12 по 28 марта два экипажа Су-24МР (гв. п/п-к Синицкий — гв. к-н Черепня, гв. п/п-к Симанович — гв. м-р Батищев) выполнили 7 вылетов на разведку в интересах командования коллективных миротворческих сил в Республике Таджикистан (КМС РТ).

Осенью 47 ОГРАП снова начал действовать в интересах главных штабов. На Северном Кавказе уже долгое время существовала самопровозглашенная Ичкерия, с которой решили покончить военным путем. Боевые действия начались в декабре, но 47 ОГРАП, обеспечивавший подготовку к этой операции, действовал в этом районе еще осенью. С 20 по 24 сентября и с 8 по 14 октября гв. п/п-к Бученов и гв. м-р Бугаев с аэр. Моздок на МиГ-25РБ выполнили 14 вылетов на разведку над районами Чечни и по границе России и Грузии.

С 1 по 26 декабря гв. п/п-к Бученов и гв. м-р Александров с аэр. Моздок на МиГ-25РБ выполнили 8 б/в на разведку над районами Чечни. В интересах вышестоящих штабов напечатано 847 фотоснимков, изготовлено 14 фотосхем. С 3 по 25 декабря 4 экипажа Су-24МР (гв. п/п-к Роднов — гв. к-н Гришин, гв. к-н Курин — гв. м-р Донецкий, гв. м-р Колобов — гв. к-н Кузнецов, гв. м-р Иванов — гв. к- н Арбузов, запасной — гв. п/п-к Цуркан) с аэр. Моздок выполнили 18 б/в на разведку в разных районах Чечни. В интересах вышестоящих штабов напечатано 6000 фотоснимков, изготовлено 45 фотосхем. В этих полетах Су-24МР постоянно подвергались обстрелу со стороны незаконных вооруженных формирований Чечни, и некоторые получали пробоины от стрелкового оружия. С серьезными повреждениями вернулся с боевого задания самолет экипажа Цуркан-Донецкий.

1995. С 16 по 30 марта пара Су-24МР (гв. п/п-ки Наевский — Давтян и гв. п/п-к Синицкий — гв. к-н Пеньков) выполнили с аэр. Какайды (Узбекистан) 18 полетов на разведку в интересах командования KMC РТ.

С 22 марта по 10 апреля экипаж Су-24МР гв. м-р Ширяев — гв. к-н Черепня с аэр. Ахтубинск выполнили 8 разведывательных вылетов над территорией Чечни.

В дальнейшем для полетов над Чечней было решено задействовать высотные МиГи, которые для стрелкового оружия, да и для «Стингеров» или «Стрел» были недосягаемы. С 12 мая по 31 октября летчики гв. п/п-к Бученов, гв. м-ры Александров, Лоскутов, Сокирко, Коваленко, Бугаев, Садовский — на трех МиГ-25РБ с аэр. Ростов-на-Дону выполнили 88 б/в на разведку над территорией ЧР. В интересах вышестоящих штабов обработано 13360 метров аэрофотопленки, изготовлено 570 фотосхем и фотопланшетов.

1996. Несмотря на сложности с поставками топлива, полк поддерживал в боеготовом состоянии экипажи основного боевого расчета, за год проведено 2 ЛТУ АЭ и 1 ЛТУ АП, при этом ЛТУ 1-й АЭ в сентябре проходило с перебазированием на оперативный аэродром Бутурлиновка.

1997. В марте командование полком принял гв. п-к А. Бондаренко, кавалер двух орденов Красной Звезды, дважды выполнявший интернациональный долг в ДРА.

С 26 августа по 1 сентября проводилось ЛТУ полка с перебазированием 6 МиГ-25РБ и 8 Су-24МР на оперативный аэродром Багай-Барановка с воздушной разведкой на новом оперативном направлении. Кроме того, в течение года выполнено 27 полетов на обеспечение командно-штабных учений и тревог вышестоящих штабов. Летчики перегоняли самолеты МиГ-25РБ/РУ из Липецка в Мончегорск.

1998. С 15 марта в связи с расформированием 16-й ВА полк вошел в состав 105-й САД и, перестав быть отдельным, с этого момента стал именоваться 47-й ГРАП.

1 мая в связи с проводимыми в российских ВВС ОШМ (организационно-штатные мероприятия, а попросту — сокращение) полку переданы Боевое Знамя, почетное наименование, ордена и другие награды (два Вымпела МО СССР), боевые традиции с Историческим формуляром 871-го ИАП в Смоленске. С этого дня получил наименование «47-й Гвардейский разведывательный авиационный Борисовский-Померанский дважды Краснознаменный ордена Суворова авиационный полк».