После того как Ростов-на-Дону был очищен от большевиков, там началось развертывание кадров возрождающейся армии. Генерал Алексеев поручил бывшему командиру эсминца капитану 2-го ранга Владимиру Николаевичу Потемкину сформировать Морскую роту, в которую бы входили продолжающие прибывать на Дон гардемарины и офицеры, а также ученики Ростовского мореходного училища. Отряд был сформирован быстро, а его первыми сестрами милосердия стали несколько учениц Ростовских гимназий. 30 января 1918 года Морская рота под командованием Потемкина вместе с Кавказским сводным дивизионом получила приказание отправляться в район Батайска для обеспечения защиты южных рубежей Ростова от наступавших большевистских частей под командованием Сорокина. Силы красных намного превосходили силы белых, как это часто бывало, к тому же наступление красногвардейцев было поддержано бронепоездом. Бой оказался жестоким и кровопролитным. Морская рота начала нести потери. Почти сразу погибли мичман Петров и мичман Александр Никитич Мельников. Тяжело был ранен осколком разорвавшегося снаряда мичман Черноморского флота Василий Тихомиров. В контратаках на противника нашли свою смерть лейтенанты Борис Евгеньевич Энвальд и Виктор Анатольевич Адамиди, увлекавшие за собой гардемарин и гимназистов, бегущих с винтовками с примкнутыми штыками наперевес навстречу наступавшим красногвардейцам. Пуля на излете ранила и самого Потемкина, повредив глаз.

Наступление красных увенчалось успехом. Невзирая на мужество оборонявших Ростов добровольцев, город был сдан. Капитан Потемкин остался в городе, скрываясь на квартире одной из сестер милосердия. Раненый мичман Тихомиров был укрыт в больнице в Новочеркасске вместе с раненым старшим лейтенантом Анатолием Петровичем Ваксмутом. Судьба Владимира Николаевича Потемкина поистине удивительна, но вполне естественна для времен Гражданской войны. Позже, с заданием командования Добровольческой армии, он с риском для жизни пробирался в Астрахань. Путь его пролегал через занятый большевиками Новочеркасск и Кисловодск, таким же путем он вернулся назад. Летом 1918 года Потемкина назначили командиром Новороссийского порта, а затем он на некоторое время возглавил команду бронепоезда «Князь Пожарский» в составе железнодорожных сил ВСЮР. В 1920 году Потемкин стал во главе дивизиона канонерских лодок Азовской флотилии, а во время крымской эвакуации, с учетом его большого организаторского таланта и умения добиваться результатов, был назначен комендантом Керчи уже в чине капитана 1-го ранга. Вместе с армией Петра Николаевича Врангеля Потемкин прибыл в Галлиполи и какое-то время командовал транспортом «Ялта». Его навыки и умение были отмечены командованием союзников, и вскоре капитан Потемкин получил предложение поступить на службу в военно-морские силы Французской республики. В их составе он и командовал 6-й группой кораблей еще долгое время, а затем вышел в отставку и вскоре скончался в Париже в 1938 году 53 лет от роду. Короткая и яркая жизнь русского морского офицера…

Не менее причудливой оказалась жизнь и Анатолия Петровича Ваксмута. По выздоровлении, совпавшем с изгнанием большевиков из Новочеркасска, он поступил служить на флот Донской флотилии, где командовал пароходом «Кубанец». В начале 1919 года он перешел на должность старшего офицера ледокола «Полезный», а летом того же года Ваксмут возглавил дивизион катеров Волжской флотилии, переместившись на восток страны. Осенью 1919 года Анатолий Петрович был назначен командиром вспомогательного крейсера «Америка» Каспийской флотилии, вывозил беженцев и части, оборонявшие Каспий от большевиков и горцев, побывал в лагере переселенцев в городке Басра в Месопотамии, короткое время являлся начальником штаба Сибирской флотилии. Когда в 1921 году эскадра адмирала Старка спасала людей, бегущих от большевизма, Анатолий Петрович стал командиром тральщика «Взрыватель», на котором он проделал всю невеселую одиссею эскадры, на пути из Гензана до Шанхая и из Шанхая на Филиппинские острова. После того как часть судов осталась на Филиппинах, Ваксмут избрал своим пристанищем сначала Китай, где проживал в Шанхае, а затем перебрался в Австралию, где в 1973 году скончался в Сиднее, окруженный детьми и внуками, оставив читающим и думающим людям свои воспоминания.

Славная Морская рота после кровопролитных боев у Батайска прекратила свое существование. Но отдельные чины ее продолжали борьбу. Так, в Первый Кубанский поход под предводительством генерала Лавра Георгиевича Корнилова отправились лейтенанты Сергей Яковлевич и Борис Яковлевич Ильвовы и старший лейтенант Анатолий Владимирович Басов, погибший в знаменитом бою под Лежанкой 21 февраля 1918 года. Позже братья Ильвовы оказались на Восточном фронте. Служить на Каспийскую флотилию отправились старшие лейтенанты Борис Михайлович Елачич и Николай Владимирович Потолов.

Судьба Елачича также примечательна. Уехав в эмиграцию в Персию в 1918 году, он вскоре решил, что русский морской офицер не должен оставаться в стороне от событий, происходивших у него в Отечестве. Вернувшись в 1919 году, Борис Михайлович вновь поступил на службу в сухопутные войска Восточного фронта, был произведен в чин капитана 2-го ранга и поставлен начальником штаба знаменитых белых Алтайских отрядов. До начала 1921 года он фактически командовал всеми белыми отрядами на Алтае, получив следующий чин капитана 1-го ранга после того, как возглавил эти подразделения, когда погиб их командир капитан Сатунин. В 1921 году Елачич перебрался в Китай, где проживал в Харбине и погиб в самом начале 1930-х годов при невыясненных обстоятельствах. Его боевой товарищ Николай Владимирович Потолов после эвакуации из Владивостока остался на жительство в Японии, короткое время проживал в Шанхае, неся бремя службы на флоте Его Величества британского монарха на таможенной канонерской лодке, а затем перебрался в Ревель, откуда позже уехал во Францию, где и скончался в 1935 году. После рассеяния Морской роты ее остатки были влиты в Офицерский полк, в рядах которого большая часть моряков погибла в Первом Кубанском походе.

Морская рота как самостоятельное подразделение в рядах сухопутных войск возникла и на Восточном фронте. Основание воинской части было положено вице-адмиралом Колчаком, командовавшим российскими войсками в полосе отчуждения Китайской восточной железной дороге, его приказом за № 38 от 21 июня 1918 года. Целью создания морской части была борьба с большевистской речной флотилией в бассейне реки Амур: флотилия состояла из двух бронированных и трех небронированных канонерок Амурской речной флотилии под командованием «товарища» Ольгиви, бывшего капитана 1-го ранга. Конечной задачей было овладение базой флотилии в Хабаровске. 12 июня 1918 года приступили к формированию морской части, получившей наименование Отдельной морской роты. Рота формировалась по штатам пешей сотни: один ротный командир, четыре взводных, 12 отделенных, фельдфебелей и 160 рядовых. На службу в роту были приняты добровольцы на общих основаниях для всех лиц, поступающих в российские войска полосы отчуждения КВЖД.

При поступлении добровольцы давали подписку, своего рода присягу на верность. В роте полным ходом шел прием желающих поступить туда для борьбы с большевизмом. Принимались офицеры флотские и сухопутные, добровольцы — специалисты морского или речного дела или те, кто был знаком с этим делом, а также все желающие продолжать службу во флоте и в будущем. Считаясь с поставленной задачей — захватить канонерку внезапным налетом с малых судов, так как никаких других плавучих средств на Сунгари в распоряжении штаба войск не было, формирование роты шло в тайне, без рекламы или объявлений о приеме в роту. Необходимость соблюдения в тайне цели формирования стесняла его успех, а само существование в Харбине морской части в глазах многих казалось странным: высказывались взгляды, что Морская рота — это почетный караул при командующем — моряки назывались «колчаковцами». Однако приток добровольцев шел успешно, и в начале июля личный состав роты достиг ста человек. Под помещение для роты была отведена одна из казарм, почти без инвентаря, расхищенного самым бесцеремонным образом китайскими войсками, занимавшими соседние казармы. Были разработаны штаты Отряда речных судов Российских войск. Схема управления намечалась следующая: начальник отряда, штаб; в подчинении начальника отряда — посыльное судно «Сретенск», дивизион сторожевых судов, отдельная морская рота.