Для проведения этой операции все войска фронта сводились в пять групп. Первой (командир И.Н. Малышев) было предписано наступать из Уфы на Маис. Второй (командир В.Н. Блохин) — двигаться в направлении Уфа — Кинель. Третьей (командир Р.И. Бер- зин) нужно было наступать из Екатеринбурга на Челябинск и Шадринск. Общее командование всеми тремя группами должен был осуществлять большевик Подвойский. Четвертая группа, наступавшая на Сызрань и Самару, оставалась под командой самого А.Ф. Мясникова. Кроме того, в направлении от Саратова на Самару наступала группа под командой А.А. Ржевского.
Плотного фронта противодействия перед советскими войсками не было, хороших дорог тоже. Вскоре после начала операции началось деление групп на более мелкие, наступавшие по самостоятельным маршрутам. Кроме того, после овладения очередным населенным пунктом из числа его жителей и примкнувших к ним «революционеров» стихийно создавались новые боевые группы, которые не желали подчиняться единому командованию.
Вскоре в рядах советских войск начались разногласия. Начальник Сызранской группы командир отряда ВЧК левый эсер Д.И. Попов отказался выполнять распоряжения советского командования и объявил себя главкомом. А.Ф. Мясников отстранил Д.И. Попова от командования отрядом, но не доложил об этом наверх. А в это самое время по приказу из Москвы отряд Попова был отозван в столицу и убыл туда во главе со своим мятежным командиром. Разграбив по пути продпункт в Инзенском, отряд Попова благополучно прибыл в Москву, где вскоре стал решающей силой мятежа левых эсеров.
Между тем чехословаки начали бои за Самару, которая была ими захвачена 8 июня. В Самару начали стягиваться все антибольшевистские силы, находившиеся в том регионе. Вскоре там был образован Комитет членов Учредительного собрания (Ко- муч), который пытался объявить себя органом государственной власти. Доминировали в самарском правительстве эсеры, сделавшие Поволжье центром своей деятельности. Под знаменем Ко- чума началось формирование белогвардейских частей, которые действовали единым фронтом с чехословаками и все больше обретали черты стройной воинской организации с общим органом управления.
В то же время действия советского командования в Поволжье носили беспорядочный, почти стихийный характер. Тяжелее всего сказывалось отсутствие опытных военачальников и штабов и, как следствие, грамотная подготовка и проведение войсковых операций. На высшие должности нередко назначались случайные, а то и откровенно враждебные советской власти люди, которые через вооруженную борьбу стремились достичь своих целей и удовлетворить собственные амбиции.
13 июня 1918 года по настоянию заместителя председателя ВЧК левого эсера Александровича командующим войсками Восточного фронта назначается член этой партии М.А.Муравьев. Новый командующий, прибыв на фронт, нашел положение дел неудовлетворительным и решительно начал все перестраивать на свой лад. Он быстро сменил многих командиров и окружил себя верными людьми, готовыми выполнять любые его приказания. Характер этих приказаний нередко был очень щепетилен и выходил за рамки военно-служебной деятельности.
Назначение на столь ответственный пост М.А.Муравьева было скорее актом отчаяния, чем осмысленным решением Кремля. Разбиравший его дела на Украине Ф.Д. Дзержинский писал: «О Муравьеве комиссия наша неоднократно получала сведения, как о вредном для советской власти командующем… грабежи и насилия — это была его сознательная военная тактика, которая, давая нам мимолетный успех, несла в результате поражение и позор…» С этой тактикой новый командующий прибыл и на Восточный фронт.
А.Ф. Мясников, вернувшись в Москву, представил В.И. Ленину и Я.М.Свердлову обстоятельную записку о положении дел на Восточном фронте. В ней он, в частности, писал: «В части проникли шкурники и трусы, преступные элементы, примазавшиеся к Советам, провокаторы, авантюристы и люди, поставившие себе целью пользоваться солдатским пайком. В частях в буквальном смысле слова не имеется командного состава. Полное отсутствие дисциплины. Приказания начальников и в особенности боевые задания не исполняются. Снабжение, организация и вообще экипировка частей стоит ниже всякой критики. Части не имеют ни обоза, ни средства для связи, ни разведывательных органов, ни хозяйства…» Это же подтвердил и вернувшийся в Москву Н.И.Подвойский.
В это время М.А. Муравьев все глубже входил во власть. Окружив себя прихлебателями и различного рода авантюристами, он постоянно кутил, направляя в Москву высокопарные телеграммы, типа: «Кампания будет очень скоро закончена. Войска всюду приветствуют меня восторженно и настроение на фронте повышается». Конкретных действий за такими телеграммами не просматривалось.
Позже, в советское время, появились статьи различных авторов о том, что восстание Муравьева — одно из звеньев большой цепи драматических политических событий лета 1918 года, организованных левыми эсерами. Возможно, это и правда. Но правда и другое — личные амбиции этого человека были выше партийной дисциплины, а стремление его к большой власти — решающим фактором. Несмотря на это, в некоторых организаторских способностях Михаилу Артемьевичу отказать трудно.
Прежде всего, для улучшения качества управления всеми силами он переместил штаб фронта в Казань. 20 июня 1918 года все действующие на громадной территории советские войска были сведены в четыре армии. 1-я армия (командующий А.И. Харченко) действовала в районе Симбирска, Сызрани и Самары. 2-я армия (командующий В.В. Яковлев) включала в себя соединения уфимского и оренбургского направлений. 3-я армия (командующий Р.И. Берзин) была сформирована из частей, действующих в районе Екатеринбург — Златоуст — Полетаево. 4-я армия (командующий А.А. Ржевский) была образована из соединений, расположенных в саратовском Заволжье.
Значимость Восточного фронта в Москве хорошо понимали. Также понимали, что командующий этим фронтом М.А. Муравьев — фигура временная и очень ненадежная. И понимал это, прежде всего, нарком по военным делам Л.Д. Троцкий, который к тому времени уже достаточно глубоко проникся заботами формирования Красной армии. В русле этой работы он стремился на все ключевые посты в РККА назначать своих людей.
Кадровые перестановки коснулись и Восточного фронта. Вместо А.И. Харченко командующим 1-й армией был назначен М.Н. Тухачевский, незадолго до этого приехавший в штаб фронта из Москвы. Вместо В.В. Яковлева командующим 2-й армией был назначен бывший полковник Ф.Е. Махин. В штабы армий были направлены кадровые офицеры, которые начали формировать оперативные и другие отделы точно по образу и подобию дореволюционной армии. Подобные кадровые перестановки были произведены и во многих соединениях (отрядах).
Между тем командующий М.А. Муравьев развернул борьбу с Реввоенсоветом фронта и политическими комиссарами, которые не поддерживали его полководческих амбиций. По этому поводу он даже жаловался в Москву: «Мои политические комиссары очень недовольны тем восторгом, с каким войска меня встречают. В операции пока не вмешиваются, но уже есть поползновения… Я, подвергающий себя ежедневной опасности, имею, кажется, право на доверие к себе…»
К лету 1918 года внутри Советской России обострилась борьба между партиями. Главной причиной этого стало недовольство политикой большевиков, подписавших с немцами Брестский мир.
6 июля 1918 года в Москве левые эсеры совершили покушение на германского посла графа Мирбаха. Это покушение, хорошо описанное в советской литературе, на самом деле хранит в себе очень много загадок. С одной стороны, данный террористический акт целиком приписывают левым эсерам, с другой — проискам самих большевиков. За вторую версию говорит то, что главный исполнитель этого убийства, некий Блюмберг, позже долгое время состоял на чекистской службе большевиков.
Позволю себе высказать и третье мнение. Данная акция была выгодна самой Германии или любой другой стране, заинтересованной в затягивании Гражданской войны в России с целью ее ослабления. Она в смертельной схватке столкнула большевиков с эсерами, расколов, таким образом, революционные силы на части. Она дала возможность Германии укрепиться не только в оккупированных ее войсками районах, но выдвинуть тяжелые требования самой Советской России. Большевиками был уничтожен Балтийский флот, а пытавшийся его спасти бывший контр-адмирал А.М. Щастный — расстрелян. Не исключено, что убийство Мирбаха было подстроено третьими силами. Некоторые намеки на это содержатся в книге главы английской миссии Роберта Локкарта, работавшего в Советской России в то время. Он пишет, что англичане, заигрывая с советским правительством, всячески поддерживали и враждебные ему силы. Для них новое столкновение Советов с Германией было очень выгодным.