Внутренние воды. Для А. в целом характерен большой годовой сток (5390 км'), по объёму которого она уступает лишь Азии и Юж. Америке. Речная сеть наиболее густа в экваториальном климате; в пустынях и на песчаных равнинах Калахари рек почти нет. Континентальный водораздел проходит вдоль восточной возвышенной части А., в связи с чем бассейну Атлантического океана принадлежит 36,05% площади А., бассейну Индийского океана 18,48%, бассейну Средиземного моря 14,88%. Сток осуществляется главным образом пятью главными реками: Конго, Нилом, Нигером, Замбези и Оранжевой, бассейны которых охватывают около 1/3 площади А. Из них Конго по объёму годового стока (1230 км3) уступает лишь Амазонке, а Нил — самая длинная река на земле (6671 км). Бессточные бассейны и области внутреннего стока охватывают 30,5% площади А.
Современная речная сеть сформировалась в конце неогена и в антропогеновом периоде за счёт перехватов молодыми реками древних систем внутреннего стока и вывода их к океанам. Следы перехватов видны в петлеобразных изгибах крупных рек (Конго, Нигера) и в чередовании выположенных и крутых отрезков русел с многочисленными порогами и водопадами (Ливингстона и Стэнли на р. Конго, Виктория на р. Замбези; самый высокий водопад А. Тугела на р. Тугела в Драконовых горах, высота 853 м). Вследствие повышения сухости климата сокращались в размерах или исчезали древние озёра, в которые стекали древние реки. Такие озёра существовали в Сахаре (Палеосахарское море к С. от излучины Нигера и др.), в Чадской котловине (Палеочадское оз.) и др.
Питание большинства рек преимущественно дождевое. Грунтовое питание преобладает в полупустынях и пустынях.
Распределение поверхностного стока крайне неравномерно. Наибольшей величины слой стока (1000—1500 мм в год) достигает в районах избыточного увлажнения и выходов на поверхность кристаллических пород и латеритных кор (северо-западное побережье Гвинейского залива, восточные склоны Мадагаскара); во впадине Конго слой стока 500—600 мм, к С. и к Ю. от экватора с нарастанием сухости климата он снижается (северная и восточная часть Судана, Сахара, Калахари, Намиб). В субтропических широтах сток увеличивается до 200 мм (на З. Атласа). Почти все реки А. имеют значительные сезонные колебания стока. У большинства рек сток бывает преимущественно летом и осенью. Зимой сток преобладает на северо-западных и юго-западных окраинах, в областях со средиземноморским климатом. 37% площади А. имеет эпизодический сток. В А. выделяют реки следующих типов:
1) экваториальный только с дождевым питанием и равномерным в году стоком;
2) суданский (наиоолее распространённый) с преобладанием дождевого питания и летнего и осеннего стока;
3) сахарский, к которому относятся временные или эпизодические водотоки (в Сахаре называются уздами);
4) средиземноморский (с дождевым и частично снеговым питанием и резким сокращением или прекращением летнего стока). Все крупные реки А. — транзитные, имеют сложные режимы.
Почти все крупные озёра А. лежат в тектонических впадинах на Восточно-Африканском плоскогорье; они длинные, узкие и очень глубокие. Оз. Танганьика — второе в мире по глубине (1435 м) после Байкала. Самое крупное в А. оз. Виктория (площадь 68 000 км2) — второй после оз. Верхнего (Сев. Америка) пресноводный водоём Земли. Оз. Тана, образованное в результате подпруживания долины лавовым потоком, — самое крупное на Эфиопском нагорье. В аридных областях А. преобладают преимущественно реликтовые озёра внутреннего стока, с относительно небольшими глубинами, плоскими берегами, солёной водой (исключая солоноватое оз. Чад, имеющее подземный сток во впадину Боделе). В северо-западной части Сахары и в Атласе временные солёные озёра называются шоттами, или себхами; они, как правило, приурочены к предгорным и межгорным котловинам.
В пустынях и полупустынях большое значение приобретают грунтовые и подземные воды. Грунтовые воды залегают на небольших глубинах под руслами временных водотоков; подземные содержатся главным образом в континентальных нижнемеловых песчаниках Сахары и Сев. Судана, в Южной А. скапливаются в трещинах коренных пород, в песчаниках и закарстованных известняках системы Карру. По потенциальным запасам гидроэнергии (700 млн. квт, около 20% мировых) А. уступает только Азии. Наибольшими запасами обладают бассейны Конго (390 млн. квт) и Замбези (137 млн. квт), но используется менее 1%. На территории А., получающей в среднем около 800 мм осадков в год, имеется возможность использовать для орошения поверхностные, грунтовые и подземные воды. Орошаемые земли составляют не более 5% всех обрабатываемых площадей и сосредоточены главным образом в долинах Нила (ОАР, Судан), Нигера (Мали) и в ЮАР. Транспортное значение рек А. невелико ввиду порожистости многих участков русел.
Почвы. Для всей А. между тропиками характерен латеритный процесс почвообразования (см. Латеритные почвы). В экваториальном климате под влажными вечнозелёными лесами развиты почвы красно-жёлтые латеритные (ферралитные) псевдопесчаной структуры, обладающие хорошей аэрацией и водопроницаемостью. Лишь в западной части впадины Конго, где сток рек сильно замедлен, большую площадь занимают латеритные глеевые и тропические болотные почвы. К С. и к Ю. от зоны красно-жёлтых почв лежат зоны красных почв, развивающиеся при сухом сезоне до 5 мес под смешанными листопадно-вечнозелёными лесами и влажными саваннами. На водораздельных равнинах во многих местах эрозия обнажает их нижние горизонты, насыщенные железистыми конкрециями и образующие панцирные латеритные коры. При нарастании сухости климата под сухими саваннами, в опустыненных саваннах и полупустынях появляются красно-бурые и красновато-бурые почвы с карбонатными конкрециями. Очень широко они развиты в Восточной А. в связи с засушливостью её климата. В котловинах Судана, Восточной и Южной А. значительные площади занимают чёрные гидроморфные и тропические болотные почвы. В районах, сложенных основными невыветрелыми лавами, распространены богатые основаниями почвы на вулканических породах. На Ю. Восточной А. и в Южной А. под редколесьями находятся крупные массивы красно-коричневых почв, более гумусированных, чем почвы саванн.
Пустынный процесс почвообразования протекает в субтропических и тропических пустынях. Почвы пустынь примитивные, щебнистые или галечниковые. Развиты древние солевые коры, бронирующие рельеф, и молодые, образующие солончаки. Почвы оазисов лугово-солончаковые и солончаки. На субтропических окраинах А. в средиземноморском климате почвы коричневые (в более влажных) и серо-коричневые (в более сухих районах), обогащенные карбонатами и гипсом. В полупустынях и пустынях — серозёмы. На южном и юго-восточном побережье в муссонных субтропиках в коричневых почвах появляется красноватый нижний горизонт.
В А. используется около 1/5 пригодных для пахоты земель, площадь которых может быть расширена при соблюдении правильной агротехники, т. к. распространённая примитивная подсечно-огневая система земледелия приводит к быстрому истощению плодородия и к эрозии почв. Наибольшим плодородием обладают чёрные тропические почвы, дающие хорошие урожаи хлопчатника и зерновых, и почвы на вулканических породах. Красно-жёлтые почвы, содержащие до 10% гумуса, и красные почвы с 2—3% гумуса требуют регулярного внесения азотистых, калийных, фосфорнокислых удобрений. Коричневые почвы содержат 4—7% гумуса, но их использование затруднено преимущественным распространением в горах и необходимостью орошения при сухом лете.
Растительность. В флоре А., изученной далеко не полностью, св. 40 000 видов и 3700 родов (900 эндемичны) цветковых растений. Северная часть А. входит в Голарктическую флористическую область. Территория А. к Ю. от Сахары принадлежит Палеотропической области, на юго-западе А. выделяется Капская флористическая область.