Эволюционисты полагают, что подобия (т.е. факты внешнего сходства) частей тела (т.н. гомологичные струк­туры) различных сортов и видов организмов являются доказательствами теории эволюции. Например, кости вер­хних конечностей человека и передних конечностей ло­шади, летучей мыши, кита, крысы и собаки имеют оп­ределенное анатомическое сходство. Считается, что это указывает на то, что все эти организмы произошли от общего предка.

Хотя эта аргументация может показаться привлека­тельной, она не может быть убедительным доказатель­ством теории эволюции, так как структурное сходство между различными организмами также согласуется с концепцией творения — творения согласно общему за­ мыслу, с модификациями, которые соответствуют осо­бым требованиям.

Однако, помимо этого, существуют некоторые фун­даментальные проблемы, связанные с использованием концепции гомологии для подтверждения эволюционной теории. По существу, гомология фальсифицирует тео­рию эволюции. Выдающийся английский эволюционист профессор Гэвин де Бир , в прошлом директор Британ­ского музея естественной истории, в своей Оксфордской монографии по биологии, озаглавленной «Гомология, нерешенная проблема», обсуждает многие доказательст­ва, противоречащие идее унаследования гомологичных структур от общего предка. Две важные области, ко­торые он в этой связи рассматривает, это эмбриология и генетика. Если бы гомологичные структуры были в самом деле унаследованы от общего предка, то мы бы смогли обнаружить присутствие гомологичных генов и существование гомологичных моделей эмбрионального развития, которые дают начало гомологичным структу­рам. Однако, на самом деле это не так, и, как подчеркивает доктор Майкл Дентон , «гомологичные структуры часто определяются негомологичными гене­тическими системами, а концепцию гомологии редко можно распространить на эмбриологию» [25, с. 44].

Однако самым дискредитирующим эволюционную интерпретацию гомологии доказательством оказались ге­нетические данные. Профессор де Бир пишет: «Теперь ясно, что то чувство гордости, с которым предполага­лось, что наследование гомологичных структур идет от общего предка, неуместно, поскольку такое наследова­ние не может быть приписано идентичности генов. Попытка обнаружить гомологичные гены были оставлена, как безнадежная…Каким же может быть механизм, который приводит к образованию гомологичных органов, одних и тех же моделей, несмотря на то, что они не контролируются теми же самыми генами? Я задал этот вопрос еще в 1938 году, и ответа на него до сих пор не получено. Бесполезно предполагать какое–либо объ­яснение в отсутствие фактов» [55, с. 3].

Поскольку гены — единицы наследственности — оп­ределяют все характеристики организма, из этого следует, что если бы организмы эволюционировали от общего пре­дка, то гены, которые определяют гомологичные струк­туры, были бы сходными. Но, как говорит де Бир, «по­пытки обнаружить гомологичные гены, кроме близкород­ственных видов, которые, согласно креационистам, лежат в пределах определенного сорта (архетипа) были остав­лены как безнадежные…» [Там же, с. 9].

Другими словами, было обнаружено, что внешне сходные гомологичные структуры определяются абсолютно различными генами. Это полностью отвергает кон­цепцию гомологии как доказательство эволюционной теории. Уильям Фикс приводит высказывания доктора Уолтера Рандалла , который кратко подводит итог этой дискуссии: «Более старые учебники эволюции много уделяли внимания идее гомологии, подчеркивая очевид­ное сходство скелетов конечностей различных животных. Таким образом, модель «пятипалой» конечности обна­руживалась в руке человека, крыле птицы, плавнике кита, и этого придерживались как указания на их общее происхождение. И вот, если бы эти различные структуры передавались бы одним и тем же комплексом генов, который подвержен изменениям под влиянием мутаций и на который воздействует естественный отбор, то эта теория была бы наделена здравым смыслом. К сожалению, это не так. Теперь известно, что гомоло­гичные органы воспроизводятся абсолютно различными комплексами генов у различных видов. Концепция го­мологии в условиях сходных генов, переданных от общего предка, была разрушена» [56, с. 67].