В ходе эксплуатации одна лодка была потеряна — К-8 в апреле 1970 года погибла в Бискайском заливе вследствие объемного пожара. Еще одна лодка — К-159 погибла в ходе ее перегона на разделку в 2003 году. В первом поколении было и два "внесерийных проекта". Один из них — РПКСН проекта 701 — представляет из себя перестройку проекта 658, а второй — проект 645 — построенная в корпусе проекта 627 ПЛА с реактором на жидкометаллическом теплоносителе.

К 67–68 году АПЛ первого поколения освоились в океане и стали представлять эффективную боевую силу, но их моральное старение и отставание от подплава противника по ТТХ — прежде всего — по уровню шумов и дальности обнаружения бортовых гидролокаторов — было заметным, и с каждым годом нарастало. На рубеже 70-х годов этот разрыв стал бы нестерпимым, но как раз в это время начали свою боевую службу АПЛ 2-го поколения. Строительство этого поколения началось в 1962-64 гг. на основе найденных по результатам испытаний первого поколения технологических решений. Первые лодки 2-го поколения вступили в строй к 50-летию Октябрьской Революции — в 1967 году. РПКСН 2-го поколения стал проект 667. Проект оказался настолько удачным, что поддерживать его на уровне требований к современной ПЛ оказалось возможным простой заменой оборудования и ракет на строящихся ПЛ, в результате чего он плавно перетек и в третье поколение. Ко второму поколению относятся его подвиды 667А (Yankee-I) 667Б (Delta-I) и 667БД (Delta II) строившихся соответственно в 1964-72, 33 единиц, 1971-77, 18 единиц, 1973-75, 4 единицы. Это были современные боевые корабли с мощным вооружением из 16 (12 на 667Б) баллистических ракет подводного старта, вместо трех надводного — на ПЛ старых типов. Ракеты этих лодок впервые получили РГЧ (пока рассеивающиеся а не инивидуального наведения). На ПЛ проекта 667Б впервые были установлены межконтинентальные баллистические ракеты — у американцев баллистические ракеты такой дальности появились лишь на ПЛ типа "Огайо" в начала 80-х годов. Одна из лодок проекта 667А — К-219 погибла 6 октября 1986 года близ Бермудских островов вследствие столкновения с ПЛА ВМФ США "Аугуста".

ПЛАРК 2-го поколения стал проект 670, натовское обозначение "Charlie" c ракетным комплексом П-40 "Аметист" и его модификация 670М "Charlie II" с ракетным комплексом П-120 "Малахит". Было построено 11 лодок проекта 670 — в 1966-72 гг., и 6 модернизированных лодок в 1973-80 гг.

Несмотря на дозвуковую скорость и меньшую дальность ракет П-40и П-120 (80 и 120 км) по сравнению с ракетами П-35 (скорость М2 дальность ~300 км), которыми был вооружен проект 675, ПЛАРК 2-го поколения явились существенным шагом вперед. Главным достижением стал подводный старт ракет, в отличие от надводного на ПЛАРК 1-го поколения, значительно сократилось время залпа, а сами ракеты шли на цель на сверхнизких высотах, что затрудняло их перехват. Значительным шагом вперед стал и сами лодки, по шумности приблизившиеся к фону океана, а на "шумных" театрах типа Средиземного моря, и терявшиеся в звуковом фоне. Правда, все еще сохранялось отставание от американцев в возможностях гидроакустики. Впрочем, проект 670М, получивший ГАК "Рубикон" с дальностью обнаружения 180 км, эту проблему уже практически снял. Следует также отметить, что ПКР подводного старта — "Sub-Harpoon" на американских ПЛ появились лишь в начале 80-х, и если проект 670 выпускал свои ПКР из наклонных шахт одним залпом в течение минуты, то американцы принимали "Гарпуны" в торпедные аппараты, и на пуск 8 ракет из двух аппаратов (еще в двух — торпеды для самообороны)у них уходило до десяти минут (заполнить аппарат водой-выстрелить-осушить аппарат-зарядить ракету-заполнить аппарат водой-выстрелить и так далее). Такая неспешность приводила к тому, что на советский корабль в случае чего шла бы редкая цепочка одиночных "гарпунов" и задача по их уничтожению значительно облегчалась. Американцам же предстояло столкнуться с несущейся к цели "стаей", боевым ордером противокорабельных ракет, маневрирующих, обменивающихся информацией и атакующих практически одновременно — ракеты выпущенные первыми замедляли свое движение с целью обеспечить возможность последующим войти в ордер. С учетом явного превосходства большей части советских кораблей над своими американскими ровесниками по уровню средств ПВО картина становилась и вовсе аховой. Но, мы отвлеклись.

ПЛА второго поколения стал проект 671. Еще один "вечный проект", перетекший из второго в третье поколение. На западе их назвали Тип "Victor" — Победитель. Восхищенные лодкой английских моряки дали ей имя "Черный принц". Ко второму поколению относятся Victor I — собственно проект 671 — и Victor-II — проект 671РТ. Эти проекты строились, соответственно, в 1966-74 гг., 15 единиц, и 1970-78 гг. 7 единиц. Проект 671РТ отличался от проекта 671 наличием более совершенного гидроакустического комплекса, пониженным уровнем шумов и установкой помимо штатных 533-мм ТА еще и двух тяжелых 650-мм ТА.

Второе поколение отметилось также и рядом замечательных одиночных и малосерийных проектов. РПКСН проекта 667АУ — "Yankee-II" с твердотопливными ракетами, одна единица. ПЛАРК проекта 661 — "Papa" — c РК на 10 ракет "Малахит", титановым корпусом, и сумасшедшей максимальной скоростью в 45 узлов, позволявшей легко уходить от торпед, одна единица. "Лодка-Автомат" проекта 705(705К) — 7 единиц, натовское обозначение — Alpha. Замечательна высокой 42-узловой скоростью, глубиной погружения до 800 метров и экипажем в 30 человек, сокращенным за счет автоматизации оборудования. (Надо отметить, что обычный экипаж ПЛА составляет 90-100 человек у нас и 130–140 у американцев, при этом их лодки, как правило, меньших размеров).