Вожаки банды (за исключением Антонова, который в тот период оказался вне поля зрения чекистов) понесли заслуженное наказание. Только Павел Эктов был помилован; он оказал впоследствии серьезные услуги при ликвидации антоновщины.

Между тем в конце мая 1921 г. командующий советскими войсками М. Н. Тухачевский приступил к решительным боевым действиям против банд антоновцев. Первый удар был нанесен в районе станции Инжавино по «второй армии» антоновцев, возглавляемой Антоновым. Против бандитов действовали конные части: бригада Г. И. Котовского, 14-я отдельная кавалерийская бригада, 7-е Борисоглебские кавалерийские курсы и другие части под общим командованием И. П. Уборевича. Бои продолжались с 29 мая по 7 июня 1921 г., в результате «вторая армия» была разгромлена. Раненый Антонов с небольшим отрядом бандитов бежал.

Затем начались операции против «первой армии» антоновцев под командованием бывшего полковника Богуславского. Она была окружена в Тамбовском уезде, но 14 июня ушла за Дон, а затем, преследуемая частями Красной Армии, оказалась в Воронежской губернии. 20 июня около г. Урюпинска (Борисоглебского уезда) советские войска настигли антоновцев, и «первая армия» была полностью уничтожена. В одном из боев Богуславский был ранен, пытался бежать, но метким выстрелом одного из бойцов автоброневого отряда ВЧК (под командованием Ю. В. Конопко) был убит.

В дальнейшем разгром мелких групп и шаек бандитов продолжался. Преследуемые воинскими частями, чекистами, добровольческими отрядами рабочих и крестьян, проклинаемые крестьянами, антоновцы разлагались. Втянутые в банды крестьяне массами уходили от Антонова, являлись с повинной к советским властям, многие из них приняли участие в боевых действиях против бандитов.

Упорно сопротивлялась «столица» антоновцев — село Каменка. Но и здесь в июне 1921 г. местные крестьяне рассказали воинам Красной Армии и чекистам о местонахождении подземелья, в котором скрывались члены губернского и уездного комитетов «Союза трудового крестьянства». Подземелье было окружено, взято, и там захвачено до 80 «активистов» антоновского движения. В подземелье обнаружены также важные документы канцелярии «Союза трудового крестьянства». 75 «активистов»-антоновцев из Каменки добровольно сдались. Инициатор восстания Г. Н. Плужников был обнаружен крестьянами в лесах района и убит при задержании.

20 июля 1921 г. председатель комиссии ВЦИК В. А. Антонов-Овсеенко сообщал в ЦК РКП (б): «Банды Антонова разгромлены. Шайки Богуславского уничтожены. Банда Карася вместе со своим атаманом ликвидирована. Бандиты массами сдаются, выдавая главарей. Само крестьянство окончательно отшатнулось от эсеро-бандитского предательства. Оно само вступает в решительную борьбу с разбойными шайками».

Подводя итоги боев с антоновцами, один из непосредственных участников ликвидации антоновщины — командующий отдельной конной группой по борьбе с антоновщиной К. В. Бриммер приводил впоследствии следующие цифры потерь антоновцев: «С 28 мая по 26 июля добровольно явилось бандитов: с оружием—1260, без оружия — 4325. Взято в облавах: с оружием — 572, без оружия — 4713, взято в плен в боях 985, убито в боях 4515. Всего — 16 370».

Последняя крупная банда антоновцев (около 500 человек) под предводительством бывшего вахмистра Ивана Матюхина была разбита отрядом Г. И. Котовского в июле 1921 г. Отряд Котовского под видом антисоветской банды — «отряда казачьего атамана Фролова», прорвавшегося с Дона и Кубани, вступил в контакт с бандой Матюхина «для совместной борьбы против Советской власти». Г. И. Котовский, принимавший личное участие в этой операции, сыграл роль «белогвардейского казачьего атамана», а бойцы его отряда — роль казаков. Участие в этой операции принял бывший офицер, служивший у Антонова, Павел Эктов, арестованный ВЧК. По указанию ВЧК Эктов; об аресте которого Матюхин не знал, вместе с отрядом Котовского вошел в расположение банды Матюхина, связался с ее участниками, представил Матюхину Г. И. Котовского как «казачьего атамана Фролова» и рекомендовал вступить в контакт с ним. 20 июля в деревне Кобылинка произошла встреча обоих располагавшихся там отрядов. По этому случаю собрались для встречи члены «штаба» матюхинской банды и комсостав «отряда казаков Фролова». Когда все собрались, Г. И. Котовский и его товарищи в короткой перестрелке уничтожили «штаб» матюхинской банды. А после этого сигнала конники Котовского разгромили всю банду. Только немногим бандитам и раненому Матюхину удалось бежать. Во время этой операции был ранен и Г. И. Котовский.

Матюхин вскоре снова образовал банду из уцелевших антоновцев. В сентябре 1921 г. она была окончательно ликвидирована. Отважные чекисты В. Г. Белугин и Ч. М. Тузинкевич проникли в эту банду, вошли в доверие к ее главарю, а затем в условленный момент вызвали из Тамбова отряд красноармейцев, который по данному ими сигналу напал и разгромил бандитов. При этом сотрудник Особого отдела армии В. Г. Белугин лично застрелил главаря банды Матюхина. Другой чекист, Чеслав Тузинкевич, геройски погиб в этом бою.

Наконец наступил и конец вожака мятежа Антонова, который скрывался в тамбовских лесах. 24 июня 1922 г. в селе Нижний Шибряй Борисоглебского уезда отряду Тамбовского губернского отдела ГПУ под командованием М. И. Покалюхина удалось выследить Александра Антонова, укрывавшегося со своим братом Дмитрием в избе Н. И. Катасоновой. При попытке задержать их Антоновы оказали вооруженное сопротивление и оба были убиты в перестрелке. В чекистском отряде по поимке Антоновых участвовали и бывшие антоновцы. Один из них, Михаил Ярцев, и застрелил вожаков бандитизма. Крестьяне благодарили чекистов за избавление от антоновщины.

Антисоветские мелкобуржуазные движения развернулись также в Саратовской и соседних с нею губерниях. Немалое влияние на них оказал мятеж, поднятый изменником Сапожковым.

Александр Сапожков, сын зажиточного самарского крестьянина, во время войны 1914–1918 гг. дослужился в царской армии до чина подпоручика. В 1917 г. он примкнул к левым эсерам, принял участие в Октябрьской революции в Саратовской губернии и пытался даже вступить в большевистскую партию. Но он постоянно колебался в политическом отношении и подпадал под кулацкое влияние. Как военный специалист Сапожков занимал ответственные посты в Красной Армии: с февраля 1919 г. командовал 22-й дивизией и участвовал в военных действиях на Уральском и Южном фронтах.

Находясь со своей частью в 1920 г. в Новоузенском уезде Саратовской губернии, где происходили кулацкие выступления, Сапожков зачастую открыто выражал солидарность с этими выступлениями. Он требовал от местных властей прекращения продовольственной разверстки, введения свободной торговли. Формируя на территории Новоузенского, Пугачевского, Бузулукского и Самарского уездов новую, 2-ю Туркестанскую дивизию, Сапожков принимал в состав дивизии не только местных дезертиров, но и соседних реакционных уральских казаков, а на командные посты назначал своих друзей, зараженных анархо-эсеровскими настроениями. В его частях почти открыто велась антисоветская агитация.

Когда командованию Заволжского военного округа стало известно о неблагополучии в частях формируемой дивизии, командующий войсками округа К. А. Авксентьевский в июле 1920 г. снял Сапожкова с поста начальника дивизии и назначил на его место другого. Эти события и послужили непосредственным поводом к мятежу. Сапожков призвал комсостав дивизии к неподчинению командованию военного округа, а 13 июля в Бузулуке начал открытый вооруженный мятеж.

Главным лозунгом сапожковского мятежа был лозунг: «Долой продразверстку, да здравствует свободная торговля!» Сапожков выдвигал еще и «левацкие» требования: выступал против «комиссаров», «спецов», «белогвардейцев», требовал «правильного распределения предметов, необходимых населению» и т. п. Оплотом его стали кулаки и дезертиры Пугачевского, Новоузенского, Бузулукского уездов, а также соседние реакционные казаки. Свою банду он пышно назвал «1-й армией правды», в некоторые моменты ее численность достигала 2500 человек.