Мать Александра и некоторые из тех, кто называл себя его друзьями, постоянно вбивали ему в голову различные слухи и сплетни, будто бы Филипп благодаря этой свадьбе собирается заключить важный союз и готовится передать царство Арридею. Опасаясь этого, он [Александр] направил Фессала, известного трагика, в Карию, чтобы тот уговорил Пиксодора [отца девушки, на которой Арридей собирался жениться] отказать Арридею, страдающему умственным расстройством и не имеющему никаких прав, и лучше отдать свою дочь за него, Александра… Однако Филипп, как только узнал об этом, тут же направился в покои сына… он сурово обругал его и с горечью упрекал в том, что Александр оказался настолько испорченным и недостойным той власти, которую он собирался ему оставить…
Свадьба по какой-то причине расстроилась, и Александр по-прежнему оставался наследником престола, однако после этой истории отношения Филиппа с младшим сыном начали стремительно портиться. В августе 338 г. до н. э., когда Филипп готовился сокрушить союз греческих городов во главе с Фивами и завоевать Южную Грецию, он получил ранение во время солдатского мятежа. Александр отразил нападение мятежников, однако Филипп так никогда и не узнал, что своим спасением он обязан сыну. Более того, после битвы при Херонее Филипп, похоже, позавидовал славе, которая выпала на долю Александра, и даже начал высмеивать его перед войсками, говоря, что у его сына такой высокий голос, что он разговаривает, словно женщина. К этому времени Александр потерял всякое уважение к отцу и, по словам Плутарха, открыто заявлял, что единственное, чем он обязан своему отцу, так это своим рождением. Он даже говорил, что больше любит своего наставника Аристотеля, потому что «…один дал ему жизнь, а другой научил его, как жить».
В 337 г. до н. э. Филипп, похоже, потерял терпение и решил, наконец, избавиться и от Олимпиады и от Александра. Во всяком случае, его женитьба на македонянке Клеопатре ясно указывала на то, что он собирается дать стране нового наследника престола. История на свадебном пиру, когда Филипп на глазах у гостей попытался ударить Александра, а тот открыто насмехался над царем, стала последней каплей, и вскоре Олимпиада с сыном покинули Македонию. В отсутствие Александра Филипп не мог лишить его наследства, кроме того, выяснилось, что большинство знати не желает больше признавать наследником царя никого другого. Филипп опасался, что среди македонской аристократии возникнут разногласия по этому вопросу, и не мог рисковать в тот момент, когда большая часть его армии находилась далеко за пределами страны. Однако, если бы Клеопатра все же родила ему сына, все могло измениться. На самом деле, через несколько месяцев даже Арридей мог бы показаться значительно более подходящей фигурой, чем прежде, для того чтобы унаследовать престол. Теперь, когда Олимпиады не было в столице, его здоровье начало резко улучшаться. Здесь можно предположить, что постоянный прессинг со стороны царицы и жизнь в тени своего младшего брата оказывали серьезное психологическое воздействие на юношу. С другой стороны, возможно, Плутарх был прав, когда обвинял Олимпиаду в том, что она просто закормила пасынка какими-то снадобьями.
В любом случае на тот момент Александр продолжал оставаться угрозой и мог превратиться в знамя для всех недовольных властью Филиппа. Кроме того, наследник пользовался в армии огромной популярностью. Поэтому царь сделал все, чтобы заставить Александра через несколько месяцев возвратиться в Пеллу, где его тут же посадили фактически под домашний арест. Теперь Филипп наконец почувствовал, что может развестись с неугомонной Олимпиадой и лишить Александра права на наследство. Это было вполне вероятно, поскольку его молодая жена все-таки родила мальчика, которого назвали Каран и о котором упоминает Юстин, либо царь мог вновь подумать о том, чтобы сделать наследником Арридея. Так или иначе, но ситуация складывалась таким образом, что Александру для того, чтобы сохранить себе жизнь, требовалось немедленно унаследовать трон. А значит, Филипп должен был умереть, и умереть быстро. И через несколько месяцев, в октябре 336 г. до н. э., царь Филипп Македонский действительно был убит молодым человеком по имени Павсаний. Тут же возникает вопрос: действовал ли этот знатный македонянин в одиночку?
Согласно сообщению Юстина, Павсаний убил Филиппа в отместку за то, что тот отказался наказать своего военачальника Аттала, который изнасиловал Павсания.
Аттал пригласил его на пир, напоил и не только сам удовлетворил с ним свою похоть, но и позволил поступить с ним, как с блудницей, всем, кто разделял с ним трапезу, из-за чего тот стал объектом насмешек со стороны своих сверстников. Разъяренный таким отношением, Павсаний часто жаловался Филиппу, однако ему под разными предлогами отказывали; продолжая подвергаться насмешкам и видя, как его враги пользуются благосклонностью военачальника, он в конце концов обратил свою обиду на самого Филиппа.
Диодор в своем сочинении также упоминает об изнасиловании, однако добавляет еще один мотив для убийства. По его словам, Павсаний был любовником македонского царя, и причиной убийства стала ревность, поскольку Филипп предпочел ему другого мужчину.
Павсаний, один из телохранителей царя, был очень любим Филиппом за его красоту. Когда он заметил, что Филипп начал испытывать сильную страсть к другому Павсанию (этого человека звали так же, как его самого), он стал оскорблять царя и назвал его гермафродитом и человеком, который принимает заигрывания первого встречного.
По мнению Плутарха, новая царица Клеопатра, племянница Аттала, тоже оказалась замешана в изнасиловании Павсания. Однако более интересно предположение Плутарха о том, что именно Олимпиада и Александр всячески поощряли Павсания отомстить и убить царя.
Вскоре после того Павсаний, оскорбленный по наущению Аттала и Клеопатры, не получив у Филиппа удовлетворения за свое бесчестие, улучил возможность и убил его. Вина за это по большей части ложится на Олимпиаду, которая, как говорят, всячески поощряла и подбивала оскорбленного юношу отомстить; некоторые подозревали в этом также и самого Александра.
Юстин также обвиняет Олимпиаду в том, что она воздействовала на Павсания из-за того, что Филипп развелся с ней. Этот автор говорит о том, что тут был замешан и Александр, потому что его отец к тому моменту уже назначил наследником Арридея.
Некоторые были даже уверены в том, что его [Павсания] совершить подобное злодеяние подстрекала Олимпиада. Мать Александра и сам Александр знали о том, что его отец должен пасть жертвой убийцы; за то, что Филипп дал ей развод и предпочел жениться на Клеопатре, Олимпиада чувствовала себя оскорбленной ничуть не меньше, чем Павсаний за то насилие, которому его подвергли. Что до Александра, то, как говорят, он опасался, что его сводный брат [Арридей] может стать его соперником в борьбе за престол.
Теперь невозможно доказать, подстрекали или нет Александр и Олимпиада Павсания, поскольку того убили при попытке скрыться с места преступления. В те времена подозрений добавил и тот факт, что главный телохранитель царя Пердикка убил Павсания, вместо того чтобы допросить его, а после оказался одним из наиболее преданных сторонников Александра в борьбе за престол. Олимпиада в момент убийства Филиппа находилась за пределами Македонии, однако она вполне могла тайно переписываться с сыном и подсказывать ему, как лучше воздействовать на потенциального убийцу. По словам Юстина, жестокая расправа, которую Олимпиада учинила над Клеопатрой и ее ребенком сразу по возвращении в Пеллу, убедила многих в том, что это именно она стояла за покушением на царя.