Когда был заключен Эдинбургский договор, Франциск и Мария Стюарт, по указанию своих советчиков, отказались ставить под ним свои подписи. Это тоже вызвало неудовольствие Елизаветы.

6 декабря 1560 года Франциск II, болезненный юноша с гнилой кровью, умер от гнойного воспаления уха. В результате политическая ситуация во Франции резко изменилась. На французском престоле воцарился его младший брат, девятилетний Карл IX, а регентшей стала его мать, Екатерина Медичи, которая при правлении своего мужа и старшего сына не пользовалась никаким влиянием, зато теперь стала вершительницей судеб, правительницей Франции. Дядья Марии Стюарт, герцоги де Гизы уехали из Парижа в свои поместья в Шампани, а сама она оказалась на обочине политической жизни Франции. Тем временем в Шотландии умерла мать Марии Стюарт, Мария де Гиз, правившая Шотландией от ее имени.

Оценив сложившуюся ситуацию, герцоги де Гизы, дядья Марии Стюарт, да и она сама принимают решение – ей следует вернуться в Шотландию, которую она покинула тринадцать лет назад пятилетней девочкой. Был снаряжен внушительный флот, который должен был доставить Марию в Шотландию. Сопровождали ее несколько дядьев, герцоги де Гизы.

Как обычно, когда совершалось плавание из Франции в Шотландию, на тот случай, если бурное море заставит путешественников причалить к берегам Англии, у англичан запрашивали гарантию безопасности. Однако Елизавета, сославшись на то, что Мария Стюарт не подписала Эдинбургский договор и продемонстрировала тем самым свое недоброжелательное отношение к английской короне, отказалась дать ей гарантию безопасности.

Мария Стюарт решила плыть безо всякой гарантии, рассчитывая на то, что хорошая летняя погода не заставит ее заходить в какой-нибудь английский порт. Английскому послу в Париже Трокмортону она сказала, что если ей придется причалить в Англии, Елизавета может сделать с ней все, что пожелает: «Если она такая жестокосердная, чтобы желать моей смерти, она может для собственного удовольствия принести меня в жертву. Непредсказуемость этой ситуации может оказаться для меня лучшей, чем жизнь. Пусть исполнится воля Божья».

Трокмортон заверил Марию Стюарт, что если она подпишет Эдинбургский договор, Елизавета даст ей гарантию безопасности и будет ей другом. Но одновременно он написал Сесилу: «Если вы хотите захватить шотландскую королеву, наши корабли должны обыскивать все суда, ибо она предпочитает прокрасться, нежели прорываться силой».

Мария Стюарт отплыла из Кале 14 августа и после пяти дней плавания благополучно высадилась в шотландском порту Лейт. Елизавета не делала никаких попыток перехватить ее.

Летом 1559 года во время переезда из одного дворца близ Лондона в другой Елизавета заболела. Видимо, это была малярия. Трокмортон, хорошо знавший Елизавету, писал Сесилу, что королева должна изменить свою диету, прекратить постоянные поездки и умерить свой аппетит. Она быстро выздоровела, но болезнь королевы заставила ее советников задуматься, что религиозное умиротворение в Англии, утверждение протестантства в Шотландии и надежды на торжество протестантства в Европе зависят от того, как долго проживет Елизавета. А если она умрет, кто унаследует английский престол? Католичка Мария Стюарт, королева шотландцев? Екатерина Грей, сестра Джейн Грей, которая как будто была протестанткой, но было известно о ее дружбе с испанским послом и симпатиях к католической вере? Или предпочтение следует отдать рьяному протестанту Генриху, лорду Гастингсу, потомку Эдуарда VI, герцогу Кларенсу?

Этой проблемы не существовало бы, если бы Елизавета вышла замуж и родила наследника престола, но она отказывала всем претендентам на ее руку. Что касается Екатерины Грэй, то у Елизаветы были основания для беспокойства по поводу нее. Екатерина крутила любовь с сыном Сомерсета Эдуардом Сеймуром, графом Хартфордом, и просила у Елизаветы разрешения на брак с ним. Согласно акту Парламента члены королевской семьи не могли сочетаться браком с кем бы то ни было без согласия короля или королевы. Елизавета такого согласия Екатерине не дала. Вероятно опасаясь, что возможная наследница престола выйдет замуж и родит ребенка, и это подтолкнет противников Елизаветы на то, чтобы сместить ее с престола и возвести на него Екатерину.

Летом 1561 года стало известно, что Екатерина беременна. Она родила сына и утверждала, что они с Хартфордом тайно обвенчались и Хартфорд является отцом ее сына. Но при этом и она, и Хартфорд отказывались назвать священника, совершившего обряд бракосочетания.

Елизавета приказала заточить Екатерину и Хартфорда в Тауэр. Стремясь дискредитировать возможную наследницу престола и ее сына, Елизавета утверждала, что никакого венчания не было и, следовательно, ребенок незаконнорожденный.

Екатерина оставалась в Тауэре узницей. Там же томился и Хартфорд. Но комендант Тауэра, нарушая приказ Елизаветы, разрешил им жить вместе как мужу с женой. В результате Екатерина родила в Тауэре еще одного сына.

Елизавета пришла в ярость и приказала перевести Екатерину из Тауэра под домашний арест в имение ее дяди лорда Грея в Ханворте Мидлссексе, а Хартфорда оставить в Тауэре. Больше Екатерина и Хартфорд никогда не встречались. Умерла Екатерина в 1568 году в возрасте тридцати лет. Сестра Екатерины, леди Мери Грей, стояла следующей после Екатерины в списке тех, кто мог унаследовать английский престол. Она была очень маленького роста, почти карлица, а влюбилась в начальника королевского караула Томаса Кейса, очень высокого мужчину, который к тому же был на двадцать лет старше ее. Когда Елизавета в 1564 году узнала, что они тайно обвенчались, она приказала заточить Кейса в тюрьму за «флирт», а Мери отправить под домашний арест в имение ее родственников. Кейс умер в тюрьме в 1571 году, Мери была освобождена и умерла через семь лет после смерти мужа.

Елизавета и Сесил с опаской и подозрительностью следили за всем, что делала Мария Стюарт, королева шотландцев. С того дня, как она вернулась в Шотландию, Мария не предпринимала никаких действий против протестантов. Ее советником был ее сводный брат лорд Джеймс Стюарт, который был один из деятельных руководителей протестантской Конгрегации во время революции. Мария дала ему титул графа Моррея и поручила управлять Шотландией от ее имени и проводить в жизнь законы против католиков.

Сама Мария регулярно служила католическую мессу в тиши своей дворцовой часовни. Но если кто-либо еще служил мессу, его подвергали жестокому наказанию. Между тем, Мария провела секретное совещание с двумя иезуитами, присланными папой римским. Она написала герцогу де Гизу, что полна решимости использовать свое положение королевы Шотландии для защиты интересов католической церкви, насколько это возможно в сложившихся весьма трудных обстоятельствах.

Мария заверяла Рандольфа, английского посла в Шотландии, что хочет установления дружеских отношений с Елизаветой, и послала в Лондон своего секретаря Уильяма Мейтленда, чтобы тот лично передал Елизавете ее заверения. Мейтланд подтвердил, что Мария признает Елизавету законной королевой Англии, но после смерти Елизаветы она должна унаследовать английский престол и просит Елизавету публично заявить, что признает Марию своей преемницей. Елизавета отказалась. «Вы полагаете, – сказала она, – что ваш план будет способствовать дружбе между нами, а я боюсь, что это принесет совершенно противоположный результат».

Елизавета не постеснялась выложить посланцу Марии свои опасения. «Я знаю непостоянство английского народа, знаю, как они всегда недолюбливают существующее правительство и возлагают свои надежды на того человека, который станет преемником. Большинство преклоняется перед восходящим солнцем, а не перед заходящим».

Она сказала, что испытала это на себе во время правления сестры, когда многие были готовы, если бы она поощрила их, свергнуть Марию и посадить ее на английский престол, и многие, кто поддерживал ее, когда она была просто леди Елизаветой, теперь настроены против нее с тех пор, как она стала королевой, ибо их надежды не оправдались. Если она теперь назовет королеву шотландцев своей преемницей, «мы можем тем самым поставить наше правление под сомнение. Я с вами откровенна, я знаю моих подданных, они любят меня, но совершенства не бывает».