К началу 1944 года еще сохранялось противостояние абвера и РСХА. Однако по мере расширения театра военных действий и ухудшения состояния на фронтах, абвер начал испытывать острую нехватку подготовленных кадров. Военная разведка не сумела своевременно доложить ни о передислокации советских войск под Сталинградом, ни о высадке союзников в Северной Африке и в Италии. В дополнение к этим неудачам британская разведка смогла перевербовать немецких агентов в Англии, и абвер захлестнуло потоком дезинформации. Все это привело к тому, что в начале 1944 года по приказу Гитлера абвер перешел в подчинение рейхсфюреру СС Генриху Гиммлеру.

Весной 1944-го Скорцени сформировал 6 «истребительных батальонов» охотников за людьми: «Ост», «Центр», «Зюд-ост», «Зюд-вест», «Норд-вест» и «Норд-ост». Их главное назначение сводилось к проведению операций против польских, советских, чехословацких, югославских, итальянских и французских партизан.

25 мая 1944 года одно из новых соединений, 500-й батальон парашютистов СС, высадился с воздуха на боснийский городок Дрвар, где находилась штаб-квартира маршала Тито и союзная военная миссия в Югославии. Однако Тито «ускользнул» – он бежал на адриатический остров Вис, находившийся под контролем англичан.

20 июля того же года было совершено самое громкое покушение на Гитлера – «заговор офицеров». Противники Гитлера стремились захватить власть. Одним из тех, кто принял участие в подавлении заговора, был Отто Скорцени. По его воспоминаниям, генерал Фромм «был вынужден признать, что вспыхнуло вооруженное восстание и он сам занят сейчас выяснением личностей зачинщиков. Несколько минут спустя генерал Бек покончил с собой, тогда как три офицера, включая начальника штаба армии резерва полковника фон Штауффенберга, предстали перед трибуналом, во главе которого встал сам Фромм. Приговоренные к смерти, эти трое были расстреляны буквально полчаса назад во дворе министерства взводом унтер-офицеров. Кроме того, в какой-то момент в коридоре первого этажа возникла беспричинная пальба…» По приказу Гиммлера Скорцени, с приданным ему батальоном, захватил здание Верховного главнокомандования и распоряжался там, верша суд и расправу в течение трех дней. После подавления мятежа Скорцени получил еще одну благодарность фюрера.

По конспиративным данным разведки, действия Скорцени имели отношения и к событиям, происходившим в Венгрии. Правителем (регентом) Венгерского королевства был Миклош Хорти. Он одним из первых среди союзников Гитлера осознал неотвратимость поражения стран оси в войне и уже с 1942 года начал секретные переговоры с союзниками. В том же 1942 году Миклош Хорти, ссылаясь на свой возраст, добился учреждения поста заместителя регента. Им стал его старший сын – Иштван. Но эта политическая расстановка сил не устраивала Берлин. 38-летний Иштван был известен как человек, отвергающий национал-социалистические идеи. Против него развернули кампанию профашистские круги в Венгрии – Ф. Салаши и Б. Имреди. Молодого Хорти обвиняли в дружбе с «еврейско-английскими кругами». А имперский министр пропаганды Геббельс, внимательно следивший за событиями в Венгрии, записал в своем дневнике, что избрание сына Хорти заместителем отца станет «большим несчастьем», ибо тот «еще больше симпатизирует евреям, чем его отец». На следующий день после избрания Иштвана Хорти заместителем регента на него было совершено покушение. А 20 августа 1942 года военный летчик и политик Иштван Хорти погиб в авиакатастрофе при невыясненных обстоятельствах. Его вдова была убеждена, что в организации «несчастного случая» с целью устранения Хорти-млaдшего были причастны диверсионные организации гитлеровцев.

В марте 1944 года Миклош Хорти был вынужден дать согласие на ввод в Венгрию немецких войск, а с ними и войск СС, которые начали депортацию евреев и цыган. При приближении советских войск к границам Венгрии Хорти сместил в августе 1944 года прогерманское правительство Стояи и назначил премьером генерала Гезу Лакатоша. В октябре 1944 года правительство Хорти объявило о перемирии с СССР. Однако вывести свою страну из войны Хорти, в отличие от короля Румынии Михая I, не удалось. 10 октября Отто Скорцени организовал похищение коменданта Будапешта – генерала Бакаи, на следующий день – командующего венгерской Дунайской флотилией Харди, необходимо было захватить и Миклоша Хорти-младшего.

15 октября 1944 года, нацистская Германия начала операцию «Панцерфауст» (известную как операция «Микки Маус»). В рамках этой операции Миклоша-младшего заманили в ловушку и похитили немецкие «коммандос» во главе с Отто Скорцени, которые угрожали убить его, если отец не выполнит требования Германии. Отец выполнил все требования (Хорти-младший пережил войну). На следующий день Скорцени организовал штурм правительственной резиденции. Во главе батальона эсэсовцев-парашютистов он ворвался в здание. Под дулом винтовки заставил премьера, генерала Лазара отдать приказ о сдаче гарнизона. Он подчинился, но тут же пустил себе пулю в лоб. Правительство лишилось охраны и было свергнуто. Новое правительство продолжило войну. Так в Будапеште произошел поддержанный Германией государственный переворот – адмирал Хорти передал власть лидеру фашистской прогерманской партии Ференцу Салаши и был вывезен в Германию, где содержался под арестом вместе с женой, невесткой и внуком, а похищенный Миклош Хорти-младший был помешен в лагерь Дахау. Сам Скорцени признавал: узнав, что венгерский регент-правитель намеревается покинуть лагерь стран оси, «мы выкрали Миклоша Хорти 15 октября, погрузив его в машину, как тюк, – завернутым в огромный ковер. После этой акции я получил еще один Золотой крест». Однако Скорцени забыл упомянуть, что он получил не только «Золотой рыцарский крест», но и звание оберштурмбаннфюрера СС.

Благодаря успешным и громким операциям популярность Скорцени росла. О нем заговорили как о «самом опасном человеке в Европе». Тенденция преувеличивать заслуги Отто Скорцени существует и сегодня: так, американский журналист и историк Хантон Доунс в своей новой книге обвинил его в убийстве Гленна Миллера! Ранее считалось, что Миллер погиб в авиакатастрофе над Ла-Маншем или был сбит, когда 15 декабря 1944 года на одномоторном самолете вылетел с британской авиабазы в Париж, чтобы подготовить рождественское выступление своего оркестра в зале «Олимпия». Однако Доунс утверждает, что Миллер направился во Францию с секретной миссией: он якобы должен был перейти линию фронта и передать командующему Западным фронтом Карлу Рудольфу Герду фон Рундштеду предложение о прекращении огня. Но Миллеру не удалось выполнить миссию, так как в Париже он был схвачен Отто Скорцени. Музыканта пытали в одном из парижских борделей на площади Пигаль, а затем, практически бездыханного, выбросили на улицу, где он и скончался. Нацисты же распространили по Парижу слух, что Миллер умер от сердечного приступа, когда был у одной из проституток.

Более достоверными являются сведения о диверсионной работе отрядов Скорцени в Нормандии. Когда англоамериканские войска, высадившиеся в Нормандии, повели наступление на территории Бельгии и Северной Франции в сторону Рейна, Скорцени получил приказ: «Вы обязаны захватить несколько мостов через Маас на участке между Льежем и Намюром. При выполнении этой задачи вы все для маскировки переоденетесь в форму противника… Кроме того, необходимо выслать вперед небольшие команды, тоже в английской и американской форме, которые должны распространять дезинформирующие приказы, нарушать связь и вносить в ряды войск противника замешательство и панику». То есть, по сути, необходимо было выполнить те же задачи, которые возлагались на подразделения «Бранденбург» в 1941 – 1943 годах.

Для этой операции были отобраны те солдаты и офицеры истребительных батальонов и парашютных частей, которые сносно говорили по-английски. Из лагерей военнопленных привезли английских и американских унтер-офицеров, они должны были научить немецких диверсантов наиболее употребительным английским фразам, американскому жаргону, преподать им формы обращения и поведения военнослужащих союзных армий (участь этих учителей была незавидна – их всех расстреляли, чтобы сохранить тайну). Доставили также английское и американское трофейное оружие (от пистолетов до пулеметов и от джипов до легких танков), обмундирование, личные документы убитых или пленных солдат, офицеров, унтер-офицеров. Разумеется, диверсантов снабдили фальшивыми фунтами и долларами, а также выдали им капсулы с ядом, которые можно было применить, чтобы избежать плена.